RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	YOR019W	Q99248	730 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	HEM2	P05373	342 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	STE7	P06784	515 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	EMP70	P32802	667 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	DOA1	P36037	715 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	SOK1	P40317	901 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	YFL054C	P43549	646 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	APS3	P47064	194 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	YLR460C	P54007	376 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	YPL107W	Q02873	248 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	ATP25	Q03153	612 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	RSM24	Q03976	319 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	YPR172W	Q06608	200 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	NMD4	Q12129	218 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	MDM12	Q92328	271 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF2	YGR129W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SPO16	P17122	198 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	AMD2	P22580	549 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	IME2	P32581	645 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MSN2	P33748	704 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	HSM3	P38348	480 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YIL067C	P40514	678 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	FKH2	P41813	862 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SHR5	P41912	237 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PGU1	P47180	361 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YGR053C	P53234	283 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	IBD2	P53892	351 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MSC1	Q03104	513 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	URH1	Q04179	340 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YMR027W	Q04371	470 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PLM2	Q04383	521 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MRL1	Q06815	381 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YLL007C	Q07799	665 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YOR365C	Q08844	703 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SFG1	Q12507	346 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	ERD1	P16151	362 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	ASK1	P35734	292 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TPO5	P36029	618 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	GLG1	P36143	616 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TRR2	P38816	342 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SEN34	P39707	275 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PZF1	P39933	429 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SLT2	Q00772	484 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RMI1	Q02685	241 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SWF1	Q04629	336 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SEI1	Q06058	285 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MET2	P08465	486 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
SYF2	YGR129W	KAR4	P25583	335 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	CWH43	P25618	953 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MNN2	P38069	597 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	DTR1	P38125	572 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	FES1	P38260	290 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	APD1	P38281	316 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YNL140C	P53910	189 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SMA2	Q04658	369 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YPR091C	Q06833	770 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YET3	Q07451	203 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RDR1	Q08904	546 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SKS1	Q12505	502 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	HEM15	P16622	393 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	VPS51	P36116	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YHL037C	P38733	133 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	GCD10	P41814	478 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TPC1	P53257	314 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YMR155W	Q03795	547 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57

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