RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	VAC7	P53950	1165 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TRM12	Q04235	462 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YKU80	Q04437	629 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GMC2	Q06201	188 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YEH1	Q07804	573 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ATG10	Q07879	167 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SRN2	Q99176	213 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MSB2	P32334	1306 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MSS18	P08593	268 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	CBS2	P14905	389 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YBR241C	P38142	488 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GGC1	P38988	300 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TIM17	P39515	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YAL037W	P39728	267 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	MNT3	P40549	630 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	AIM22	P47051	409 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YJR096W	P47137	282 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YJR154W	P47181	346 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PMT3	P47190	753 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	COS12	P53053	380 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RIF2	Q06208	395 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YEH2	Q07950	538 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SGT1	Q08446	395 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TRM8	Q12009	286 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ULA1	Q12059	462 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	CCH1	P50077	2039 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	CDC21	P06785	304 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RAP1	P11938	827 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PHO81	P17442	1178 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	CIN8	P27895	1000 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ATP11	P32453	318 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SRX1	P36077	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TAE1	P38340	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	INM1	P38710	295 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TRM5	P38793	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GAB1	P41733	394 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GPI8	P49018	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SDT1	P53078	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	AQR1	P53943	586 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ECM9	Q02202	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SPC2	Q04969	178 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	GLO2	Q05584	274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	NDL1	Q06568	189 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RAD34	Q06665	692 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	STP4	Q07351	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ATP4	P05626	244 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	STE4	P18851	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	REC107	P21651	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ADE1	P27616	306 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	HXT4	P32467	576 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SRB5	P32585	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	TFB1	P32776	642 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	SPO23	P33757	523 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	PIM1	P36775	1133 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CPR4	YCR069W	ROT2	P38138	954 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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