RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592052.1

TMEM259-208, Transcript of transmembrane protein 259, human

Gene TMEM259, Length 1,637 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-208	ENST00000592052	SOX10	P56693	466 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	ERMN	Q8TAM6	284 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	KAT2B	Q92831	832 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	PPP6R2	O75170	966 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC26A2	P50443	739 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	STK24	Q9Y6E0	443 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TMEM259-208	ENST00000592052	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	COL6A1	P12109	1028 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CHMP4BP1	P59074	171 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	MFSD10	Q14728	455 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	SPATA32	Q96LK8	384 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	AK8	Q96MA6	479 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	PSEN2	P49810	448 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	BANK1	Q8NDB2	785 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	NEK9	Q8TD19	979 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	PSMC5	P62195	406 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	PSMC6	P62333	389 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	RGL1	Q9NZL6	768 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	HAS3	O00219	553 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	MARK3	P27448	753 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	GRIN1	Q05586	938 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	UGCG	Q16739	394 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	DYDC2	Q96IM9	177 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	SLITRK3	O94933	977 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	ME1	P48163	572 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CYP4A11	Q02928	519 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	KRT79	Q5XKE5	535 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	LXN	Q9BS40	222 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CSRNP2	Q9H175	543 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	PP2D1	A8MPX8	630 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	ITGA7	Q13683	1181 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	TPH2	Q8IWU9	490 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CLIC6	Q96NY7	704 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	RPA1	P27694	616 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CDC25A	P30304	524 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	PRKCE	Q02156	737 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	POTEB3	A0JP26	581 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	ZNF862	O60290	1169 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CUTA	O60888	179 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	PLCB4	Q15147	1175 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	POTEB	Q6S5H4	581 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	C7orf31	Q8N865	590 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	FAM167A	Q96KS9	214 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	TRPC6	Q9Y210	931 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TMEM259-208	ENST00000592052	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ATP4A	P20648	1035 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	UBA7	P41226	1012 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	MED24	O75448	989 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	OAT	P04181	439 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TMEM259-208	ENST00000592052	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03

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