RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 RRN3P2A6NIE6 340 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 PI4K2BG5E9Z4 385 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 ENPP3O14638 875 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 GPR37L1O60883 481 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 IL9P15248 144 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 NECTIN1Q15223 517 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 FBXO47Q5MNV8 452 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 MARCH8Q5T0T0 291 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 AZI2Q9H6S1 392 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 CDY2AQ9Y6F7 541 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.38■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 H3BQ06 376 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 IGBP1P78318 339 aa27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.37■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 BMPR1AP36894 532 aa27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 IER5Q5VY09 327 aa27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 FAM50BQ9Y247 325 aa27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 TTC3P53804 2025 aa27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 MYO7AQ13402 2215 aa27.36■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 NCK2O43639 380 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 INSRRP14616 1297 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 RNF20Q5VTR2 975 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 SDF4Q9BRK5 362 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 TRPC6Q9Y210 931 aa27.35■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 M0QZ92 97 aa27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 NAPAP54920 295 aa27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 COL19A1Q14993 1142 aa27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 PCYT2Q99447 389 aa27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 C11orf16Q9NQ32 467 aa27.34■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 FAM86C2PA6NEL3 165 aa27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 CLDND1Q9NY35 253 aa27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 SQORQ9Y6N5 450 aa27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 NFASCO94856 1347 aa27.33■■□□□ 1.97
PBX1-217ENST00000559578 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 LINC00271P0C7V0 271 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 CD52P31358 61 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 APOA5Q6Q788 366 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ZBTB10Q96DT7 871 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.32■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 GRM6O15303 877 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 DGKIO75912 1065 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ALADP13716 330 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 STAT5BP51692 787 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ACTR2P61160 394 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 CEP55Q53EZ4 464 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 NEK1Q96PY6 1258 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PLVAPQ9BX97 442 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 TRPV2Q9Y5S1 764 aa27.31■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.3■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ADCY7P51828 1080 aa27.3■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PLCB4Q15147 1175 aa27.3■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 RTN1Q16799 776 aa27.3■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ZBTB43O43298 467 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ARP10275 920 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 TMEM62Q0P6H9 643 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PGBD1Q96JS3 809 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 ANO3Q9BYT9 981 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PRKAG3Q9UGI9 489 aa27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa27.28■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa27.28■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 SLC26A2P50443 739 aa27.28■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 PAK2Q13177 524 aa27.28■■□□□ 1.96
PBX1-217ENST00000559578 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms