RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443597.6

LRRC23-209, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC23, Length 1,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-209ENST00000443597 PSEN2P49810 448 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 MFSD10Q14728 455 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 SDF4Q9BRK5 362 aa20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 CHMP4BP1P59074 171 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 LAMA3Q16787 3333 aa20.48■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 LGR5O75473 907 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TOX2Q96NM4 488 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 VAV3Q9UKW4 847 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 EMSYQ7Z589 1322 aa20.47■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 H3BRB1 525 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 PANK2Q9BZ23 570 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 TBX21Q9UL17 535 aa20.46■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 ATP2B1P20020 1258 aa20.45■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 HOXC8P31273 242 aa20.45■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.45■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 SESTD1Q86VW0 696 aa20.45■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 RIT2Q99578 217 aa20.45■□□□□ 0.87
LRRC23-209ENST00000443597 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 CLTBP09497 229 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 MARK3P27448 753 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 BRAPQ7Z569 592 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 TSPY26PQ9H489 355 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.45■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 CHMP2AO43633 222 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 GAS7O60861 476 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ATP4AP20648 1035 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 WNT8BQ93098 351 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 MTMR9Q96QG7 549 aa20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 EML1O00423 815 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 CYP2C9P11712 490 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 MCM7P33993 719 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 KRT76Q01546 638 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 UGCGQ16739 394 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.43■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 KIAA0355O15063 1070 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ZNF174Q15697 407 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 RBSNQ9H1K0 784 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SCN5AQ14524 2016 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 NEMFO60524 1076 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ADAM17P78536 824 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 TTC38Q5R3I4 469 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 C7orf31Q8N865 590 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.42■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SIP14410 1827 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 TBX3O15119 743 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 ZNF862O60290 1169 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 PPP2R5CQ13362 524 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 PLCB4Q15147 1175 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 KAT6AQ92794 2004 aa20.41■□□□□ 0.86
LRRC23-209ENST00000443597 GLG1Q92896 1179 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms