RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.82	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SWI1	P09547	1314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	DSF1	P0CX08	502 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CBF1	P17106	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ZRC1	P20107	442 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PPA2	P28239	310 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PEX3	P28795	441 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ECT1	P33412	323 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	LST4	P34239	828 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	VPS51	P36116	164 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MNN2	P38069	597 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YMR262W	P38430	313 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ATM1	P40416	690 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	NDC80	P40460	691 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MRPS35	P53292	345 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	IPI3	P53877	555 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	STD1	Q02794	444 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MRP51	Q02950	344 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PRM15	Q03262	622 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	VPS36	Q06696	566 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	GEP3	Q08622	556 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MRP13	P12686	339 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	VPS34	P22543	875 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	GIT1	P25346	518 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YIM1	P28625	365 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PRR1	P28708	518 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PRE4	P30657	266 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.8	□□□□□ -1.8	not detected
PAM18	YLR008C	SPO23	P33757	523 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ALP1	P38971	573 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YNL195C	P40168	261 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	VHS2	P40463	436 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ICE2	P40499	491 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	GAB1	P41733	394 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	STB2	P46679	850 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	FMP33	P46998	180 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	IRC8	P47046	822 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	COS5	P47187	383 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YPT11	P48559	417 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RRN9	P53437	365 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YNL260C	P53846	198 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MRS2	Q01926	470 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TAF12	Q03761	539 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	DCS1	Q06151	350 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ARO10	Q06408	635 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	COS7	Q07788	383 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ALE1	Q08548	619 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RAX1	Q08760	435 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RAD3	P06839	778 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SNF6	P18888	332 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YSR3	P23501	404 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	URK1	P27515	501 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MEI4	P29467	408 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YPS1	P32329	569 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SRB5	P32585	307 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	FRE1	P32791	686 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	NUF2	P33895	451 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	AST1	P35183	429 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	DOA1	P36037	715 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	LDB7	P38210	180 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	EHT1	P38295	451 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YJL193W	P39542	402 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	GID8	P40208	455 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YIL001W	P40560	513 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	HXT9	P40885	567 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CHA4	P43634	648 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8

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