RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	MDG1	P53885	366 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RSM27	YGR215W	DCS1	Q06151	350 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RSM27	YGR215W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RSM27	YGR215W	HOM3	P10869	527 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ERV1	P27882	189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SPR1	P32603	445 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	CSE2	P33308	149 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	JLP2	P40206	208 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	TAF12	Q03761	539 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ACL4	Q03771	387 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	BCH1	Q05029	724 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SRL2	Q12020	392 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	PCL1	P24867	279 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ADK2	P26364	225 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	BRO1	P48582	844 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SHY1	P53266	389 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	IMA2	Q08295	589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	FDH1	Q08911	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	VPS54	Q12071	889 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	AHC1	Q12433	566 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	HXT1	P32465	570 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	KAR9	P32526	644 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	UTH1	P36135	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SFH5	P47008	294 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SPC19	Q03954	165 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	MMR1	Q06324	491 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	IRC25	Q07951	179 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	CLB1	P24868	471 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	RPC53	P25441	422 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	CHK1	P38147	527 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SLM4	P38247	162 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	HAL1	Q01766	294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	PDX1	P16451	410 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	HEL1	P36113	551 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YIL029C	P40538	142 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ZIM17	P42844	174 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	MDE1	P47095	244 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ADA2	Q02336	434 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	CCE1	Q03702	353 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	BSC6	Q08280	497 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ATG34	Q12292	412 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	COX3	P00420	269 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YCL068C	P25593	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SBE22	P38814	852 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	SER3	P40054	469 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	MTQ1	P53944	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	HOT1	Q03213	719 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	RMT2	Q03305	412 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	AIM32	Q04689	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	IZH2	Q12442	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	MTR10	Q99189	972 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	DBF4	P32325	704 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	YKL097C	P34245	136 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	BUG1	Q12191	341 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ISA2	Q12425	185 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RSM27	YGR215W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	COX14	P39103	70 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	TCB2	P48231	1178 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	MRM2	P53123	320 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	STD1	Q02794	444 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	URH1	Q04179	340 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RAX1	Q08760	435 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	NUP2	P32499	720 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	MIG3	P39943	394 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	SIM1	P40472	476 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	NDE2	Q07500	545 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	MED2	Q12124	431 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	NCA2	Q12374	616 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	VHS2	P40463	436 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	GAB1	P41733	394 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	LCB3	P47013	409 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	BIR1	P47134	954 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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