RNA–Protein interactions for RNA: YDL033C

SLM3, Transcript of tRNA-specific 2-thiouridylase, yeastyeast

Gene SLM3, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3YDL033C UBC12P52491 188 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C AQR1P53943 586 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C INA17Q02888 182 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ARO10Q06408 635 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SYT1Q06836 1226 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YOL107WQ12239 342 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PNS1Q12412 539 aa7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YBR085C-AO43137 85 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C TRX2P22803 104 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C FPS1P23900 669 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RHB1P25378 209 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ZRT3P34240 503 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SEA4P38164 1038 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YBR137WP38276 179 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C FTH1P38310 465 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C BIT2P38346 545 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C WSC4P38739 605 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C VAC8P39968 578 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YJR154WP47181 346 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MRX6P48564 524 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MNN10P50108 393 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C EFM5P53200 248 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ARP4P80428 489 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C REG1Q00816 1014 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RLI1Q03195 608 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C NHP10Q03435 203 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C AIM36Q03798 255 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SIZ1Q04195 904 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YLR345WQ06137 509 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C CRN1Q06440 651 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ASR1Q06834 288 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C OPI10Q08202 246 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MCD1Q12158 566 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C HAL9Q12180 1030 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YPL247CQ12523 523 aa7.5□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C HIS1P00498 297 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C GCN4P03069 281 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C DAL81P21657 970 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C IDP1P21954 428 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RNP1P32385 249 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SDS22P36047 338 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C CAF4P36130 643 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RIB1P38066 345 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PPE1P38796 400 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C TIF34P40217 347 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YPS6P40583 537 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YFR018CP43599 363 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C TOM22P49334 152 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PEX31P53203 462 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C NUP116Q02630 1113 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RRN5Q02983 363 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YML131WQ03102 365 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C GAS3Q03655 524 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SSY1Q03770 852 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C TRM82Q03774 444 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ARA2Q04212 335 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YDR514CQ04408 483 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YLR283WQ05867 314 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SLD7Q08457 257 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YLR049CQ12110 428 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PER33Q12144 273 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ATP14Q12349 124 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C SUS1Q6WNK7 96 aa7.49□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RPS17AP02407 136 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ARG81P05085 880 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MIS1P09440 975 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RPS17BP14127 136 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C AAT2P23542 418 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C CNB1P25296 175 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ERG9P29704 444 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PDR3P33200 976 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C CBT1P36038 271 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C VRP1P37370 817 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C OCA5P38738 679 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MNN1P39106 762 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PRM9P39551 298 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C EDC3P39998 551 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C COG3P40094 801 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C LSM8P47093 109 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C GPI8P49018 411 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MRPS16Q02608 121 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C VHS1Q03785 461 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ECM11Q04110 302 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RNH1Q04740 348 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C RSC58Q07979 502 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C YLR046CQ12253 270 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C BMT6Q12291 365 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C MED4Q12343 284 aa7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C COX3P00420 269 aa7.47□□□□□ -1.21
SLM3YDL033C ALG7P07286 448 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 240.6 ms