RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	SPR6	Q01684	191 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YOL131W	Q08270	108 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YLL054C	Q12244	843 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RAP1	P11938	827 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	UNG1	P12887	359 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	DAP2	P18962	818 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NPR1	P22211	790 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	CTR86	P25355	563 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	HXT4	P32467	576 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SEC17	P32602	292 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	KAE1	P36132	386 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YKR073C	P36153	106 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YBR071W	P38243	211 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RCK1	P38622	512 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	HXT7	P39004	570 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ERV46	P39727	415 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NDE1	P40215	560 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	OSW5	P40219	148 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SER33	P40510	469 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PFA3	P42836	336 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	LEM3	P42838	414 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GYP8	P43570	497 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	FAR7	P43592	221 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.29	□□□□□ -1.4	not detected
MIA40	YKL195W	SHE4	P51534	789 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ZRG17	P53735	605 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	REH1	Q06709	432 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	THP1	Q08231	455 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	FLC1	Q08967	793 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NMD4	Q12129	218 aa		6.29	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YKR104W	P0CE69	306 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PMT1	P33775	817 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SOL2	P37262	315 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ASI1	P54074	624 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	EAR1	Q03212	550 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SMP3	Q04174	516 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ARG7	Q04728	441 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.28	□□□□□ -1.4	not detected
MIA40	YKL195W	MED7	Q08278	222 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MLH3	Q12083	715 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ATG29	Q12092	213 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GLE1	Q12315	538 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YDL199C	Q12407	687 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	VCX1	Q99385	411 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GAL3	P13045	520 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NEM1	P38757	446 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YHR078W	P38799	552 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YAR028W	P39548	234 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GCV1	P48015	400 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RTS3	P53289	263 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SFB2	P53953	876 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SWP1	Q02795	286 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RRN5	Q02983	363 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YHM2	Q04013	314 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GAD1	Q04792	585 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	VPS74	Q06385	345 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	ATG10	Q07879	167 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TRM8	Q12009	286 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TAO3	P40468	2376 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CLB2	P24869	491 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TRX3	P25372	127 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	PPZ1	P26570	692 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NUP2	P32499	720 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SPO23	P33757	523 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CBP4	P37267	147 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RIB1	P38066	345 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TAE1	P38340	232 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YEL073C	P39974	107 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	IES5	P40060	125 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	AVT6	P40074	448 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	LAS21	P40367	830 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	AAT1	Q01802	451 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YPL071C	Q02864	156 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GIP3	Q03016	1276 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SRL4	Q03085	281 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RSN1	Q03516	953 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	APC4	Q04601	652 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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