RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	KIN82	P25341	720 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	HCM1	P25364	564 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	BUB3	P26449	341 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SNC1	P31109	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ARO7	P32178	256 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	NDC1	P32500	655 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	UTR2	P32623	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ISC10	P32645	267 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YKL162C	P36052	402 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SFB3	P38810	929 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	LNP1	P38878	278 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	POP1	P41812	875 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GYP8	P43570	497 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GAT1	P43574	510 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	CNN1	P43618	361 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	BNA6	P43619	295 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	MRX5	P47007	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ECM27	P47144	725 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YGR026W	P53217	278 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YDR514C	Q04408	483 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GAD1	Q04792	585 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SSK1	Q07084	712 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	MDM32	Q12171	622 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.37	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SWI5	P08153	709 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	TFS1	P14306	219 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	UTR1	P21373	530 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ITR1	P30605	584 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	AFR1	P33304	620 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	NSG1	P38837	291 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	AYR1	P40471	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YJR154W	P47181	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ARL3	Q02804	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	EMI1	Q04406	187 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	BCH1	Q05029	724 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GRC3	Q07845	632 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	NRT1	Q08485	598 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GPM2	Q12008	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SFG1	Q12507	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ABF1	P14164	731 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	PRP28	P23394	588 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SIF2	P38262	535 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	PPE1	P38796	400 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YAR028W	P39548	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GEM1	P39722	662 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	MIT1	P40002	666 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	FMP52	P40008	231 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	NET1	P47035	1189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YJR030C	P47101	745 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ERV29	P53337	310 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	CDC14	Q00684	551 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	RMI1	Q02685	241 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	PEX12	Q04370	399 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	ECM7	Q06200	448 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	AIM39	Q08223	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	DCN1	Q12395	269 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	QCR7	P00128	127 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	SCO2	P38072	301 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YBL029W	P38201	376 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	CCZ1	P38273	704 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	XDJ1	P39102	459 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	AIM2	P39721	246 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	RGI2	P40188	164 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YTA6	P40328	754 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	PRM10	P42946	383 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	NUP49	Q02199	472 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	RRN5	Q02983	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YML131W	Q03102	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	MSS11	Q03825	758 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	GAS2	Q06135	555 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.36	□□□□□ -1.87
MTR4	YJL050W	IES4	Q08561	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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