RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	AIM39	Q08223	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	COR1	P07256	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SPO16	P17122	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	EXO70	P19658	623 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VPS33	P20795	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	KRE6	P32486	720 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SRB2	P34162	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YBR139W	P38109	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	APM3	P38153	483 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YBP1	P38315	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	MSR1	P38714	643 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	LYS9	P38999	446 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SOK1	P40317	901 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	MSS2	P40990	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SMK1	P41808	388 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YFR018C	P43599	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	TOM22	P49334	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SDH1	Q00711	640 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	TOF2	Q02208	771 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PIR3	Q03180	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	FMN1	Q03778	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RSC58	Q07979	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	MUM3	Q08750	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SVS1	Q12254	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	DCN1	Q12395	269 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	GAL3	P13045	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SIR1	P21691	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	ATG22	P25568	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YBR032W	P38223	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	FRT2	P39734	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	STL1	P39932	569 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YMR134W	P40207	237 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	MAM33	P40513	266 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	GTT1	P40582	234 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	UFE1	P41834	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	AIM24	P47127	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	ASI2	P53895	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
SIF2	YBR103W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PGC1	Q08959	321 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	GTT2	Q12390	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VPS34	P22543	875 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VMA16	P23968	213 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YSP3	P25036	478 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	AAD3	P25612	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	NAM9	P27929	486 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	DGR2	P32330	852 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SPT14	P32363	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SLC1	P33333	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YKL100C	P34248	587 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YDR089W	P38966	869 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SEO1	P39709	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	UBP7	P40453	1071 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SLM1	P40485	686 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	CHS6	P40955	746 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RTT101	P47050	842 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PEX31	P53203	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	NMA2	P53204	395 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	NHP10	Q03435	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VHS1	Q03785	461 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	SEG1	Q04279	960 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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