RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572021.5

TRIM25-205, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 1 (best)

Gene TRIM25, Length 1,555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-205	ENST00000572021	EVI5	O60447	810 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	CYP3A4	P08684	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	PRR16	Q569H4	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	GJA10	Q969M2	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	TDP2	O95551	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	GJB2	P29033	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	NEDD9	Q14511	834 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	SYN1	P17600	705 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	DGKD	Q16760	1214 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	LENG9	Q96B70	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRIM25-205	ENST00000572021		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	USP11	P51784	963 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	TLE2	Q04725	743 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	KAT2B	Q92831	832 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	GPR20	Q99678	358 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ELP1	O95163	1332 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021		H0YGN5	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ARVCF	O00192	962 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	WNT7A	O00755	349 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SLC37A4	O43826	429 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CIITA	P33076	1130 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CUL4A	Q13619	759 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SNX17	Q15036	470 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	MSH4	O15457	936 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	MAFG	O15525	162 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CABYR	O75952	493 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	LGALS2	P05162	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	MCM4	P33991	863 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CDK7	P50613	346 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	KPNA6	O60684	536 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CCNE2	O96020	404 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	PSEN2	P49810	448 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	MFSD10	Q14728	455 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	NFASC	O94856	1347 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	CYP3A7	P24462	503 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TRIM25-205	ENST00000572021	ACTR2	P61160	394 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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