RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF609	O15014	1411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708		H3BQV1	296 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CLGN	O14967	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RAD17	O75943	681 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	GHRH	P01286	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ELN	P15502	786 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	VAMP1	P23763	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FOXO4	P98177	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ATP11A	P98196	1134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CHRND	Q07001	517 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	STK3	Q13188	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	KCNB2	Q92953	911 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	BRF1	Q92994	677 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	PSMD14	O00487	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	SLC27A2	O14975	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FANCG	O15287	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	JAK2	O60674	1132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CIAO1	O76071	339 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CP	P00450	1065 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	TCF3	P15923	654 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	EPS15	P42566	896 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ECE1	P42892	770 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CORO7	P57737	925 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ORC1	Q13415	861 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	BRD3	Q15059	726 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SFI1-224	ENST00000486708	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms