RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	MDM34	P53083	459 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	COG7	P53195	279 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YNR068C	P53754	272 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YNL140C	P53910	189 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YNL034W	P53963	612 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YDR239C	Q03780	787 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TMN2	Q04562	672 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	COS7	Q07788	383 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YPR011C	Q12251	326 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RGT2	Q12300	763 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NTO1	Q12311	748 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	AHC1	Q12433	566 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MHT1	Q12525	324 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	KSS1	P14681	368 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PRI2	P20457	528 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	UBC8	P28263	218 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PTP2	P29461	750 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NTG1	P31378	399 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	COQ2	P32378	372 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	STE5	P32917	917 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	LHS1	P36016	881 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YKR015C	P36111	568 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GMH1	P36125	273 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	OMA1	P36163	345 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	COS111	P38308	924 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MED6	P38782	295 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	APE4	P38821	490 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SWD1	P39706	426 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NEO1	P40527	1151 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YFR018C	P43599	363 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	STB2	P46679	850 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YJR030C	P47101	745 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YJR149W	P47177	404 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TOM22	P49334	152 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MPS2	P53159	387 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YGR015C	P53208	328 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GOR1	P53839	350 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	VHS1	Q03785	461 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	EMI1	Q04406	187 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GRS2	Q06817	618 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	NSE1	Q07913	336 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YLR122C	Q12312	125 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MHF2	Q3E829	80 aa		6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RAD7	P06779	565 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TFB1	P32776	642 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ECM4	P36156	370 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YBR138C	P38277	524 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	INM1	P38710	295 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YJL070C	P40361	888 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YRB2	P40517	327 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	6.31	□□□□□ -1.4	not detected
MIA40	YKL195W	MON1	P53129	644 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MPS1	P54199	764 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RAD30	Q04049	632 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MFG1	Q07684	458 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MDM12	Q92328	271 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		6.31	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TIM9	O74700	87 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MSF1	P08425	469 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	CLN2	P20438	545 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GRR1	P24814	1151 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RPC82	P32349	654 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	IML3	P38265	245 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YBR285W	P38354	144 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ATG7	P38862	630 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MSS2	P40990	351 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MET12	P46151	657 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	AIM22	P47051	409 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SAM37	P50110	327 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TGL2	P54857	326 aa		6.3	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	SDH1	Q00711	640 aa		6.3	□□□□□ -1.4

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