RNA–Protein interactions for RNA: YJR010W

MET3, Transcript of ATP sulfurylase, yeast

Gene MET3, Length 1,536 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MET3	YJR010W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	UGA1	P17649	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	GEX1	P25596	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	KRE2	P27809	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	COQ2	P32378	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	KKQ8	P36004	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	TCD1	P38756	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YIR014W	P40570	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YFR020W	P43600	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ATG27	P46989	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	PRY1	P47032	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MUP1	P50276	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YIP4	P53093	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MND1	P53102	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	SNO2	P53823	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	EKI1	Q03764	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	DLT1	Q04216	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	DUS4	Q06063	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	CYK3	Q07533	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	PCL8	Q08966	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ALG1	P16661	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MSN4	P33749	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RPC37	P36121	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	PXL1	P36166	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YPT10	P38146	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	TSC10	P38342	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	END3	P39013	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	OPT1	P40897	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YHC3	P47040	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YGL114W	P53134	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	UFO1	Q04511	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	IPK1	Q06667	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MDM36	Q06820	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RRD2	Q12461	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	LYS2	P07702	1392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RIP1	P08067	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ERG11	P10614	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RSR1	P13856	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	CDC42	P19073	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YCL068C	P25593	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	GAC1	P28006	793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	SWC5	P38326	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YHR210C	P38893	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	PLB1	P39105	664 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	AIM22	P47051	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	COG2	P53271	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	DIP5	P53388	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MNT4	P53745	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	SLG1	P54867	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MSC1	Q03104	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YML053C	Q04978	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RRG8	Q06109	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	VAC14	Q06708	880 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ENB1	Q08299	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RKI1	Q12189	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	BUG1	Q12191	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	GID7	P25569	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	BEM1	P29366	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ECM25	P32525	599 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	APL3	P38065	1025 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	VHC1	P38329	1120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MNL1	P38888	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	ROG1	P53118	685 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	VOA1	P53262	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RTT102	P53330	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	POS5	Q06892	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	MLH3	Q12083	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MET3	YJR010W	RSF2	P46974	1380 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	RAD50	P12753	1312 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	RIM15	P43565	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	COR1	P07256	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	PET111	P08468	800 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	GPA1	P08539	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
MET3	YJR010W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	EFM2	P38347	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	PCA1	P38360	1216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	DBP8	P38719	431 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	YJL070C	P40361	888 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MET3	YJR010W	ATM1	P40416	690 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.4 ms