RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC53	A6NM62	1247 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC63	Q05C16	580 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	TSG101	Q99816	390 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	HINFP	Q9BQA5	517 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	ANO3	Q9BYT9	981 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		14.52	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PRR16	Q569H4	304 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC17	Q96LX7	622 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	POTEB2	H3BUK9	544 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	AKR1B10	O60218	316 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G4B	P0C869	781 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ICA1	Q05084	483 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	EHHADH	Q08426	723 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	GPBP1	Q86WP2	473 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CAGE1	Q8TC20	777 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	POLD4	Q9HCU8	107 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	RAB21	Q9UL25	225 aa		14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQJ5	194 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	POTEF	A5A3E0	1075 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MEIS1	O00470	390 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ERLIN1	O75477	346 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ZMYND10	O75800	440 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	POTEI	P0CG38	1075 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PDE6B	P35913	854 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	KIF11	P52732	1056 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	APBA1	Q02410	837 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	FIGN	Q5HY92	759 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	POTEG	Q6S5H5	508 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MTMR8	Q96EF0	704 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MASTL	Q96GX5	879 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PSMB7	Q99436	277 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152		H3BQF6	201 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	VAV2	P52735	878 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PODN	Q7Z5L7	613 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		14.51	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	UTRN	P46939	3433 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	VGLL3	A8MV65	326 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152		F5H6K3	240 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MED24	O75448	989 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	KLRC3	Q07444	240 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MEIS2	O14770	477 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD2	Q13200	908 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	NEK11	Q8NG66	645 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	EHD4	Q9H223	541 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM51	Q9NW97	253 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		14.5	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	LTBP1	Q14766	1721 aa		14.49	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MAP2K7	O14733	419 aa		14.49	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	ECE2	O60344	883 aa		14.49	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	MOCS3	O95396	460 aa		14.49	□□□□□ -0.09
BRF1-222	ENST00000635152	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09

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