RNA–Protein interactions for RNA: YMR293C

HER2, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene HER2, Length 1,395 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HER2	YMR293C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	STB6	P36085	766 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	PIM1	P36775	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SSU1	P41930	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SAD1	P43589	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	IKS1	P47042	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SIL1	Q08199	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RKR1	Q04781	1562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RIP1	P08067	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	REC107	P21651	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	BUB3	P26449	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YME2	P32843	850 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	GCS1	P35197	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YJL070C	P40361	888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	POP1	P41812	875 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	FMS1	P50264	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	ROY1	Q04847	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	NRT1	Q08485	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	DAP1	Q12091	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	DRS2	P39524	1355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	EXO70	P19658	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	NIP100	P33420	868 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	IRC15	Q02733	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RMT2	Q03305	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	VPS74	Q06385	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SEC63	P14906	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	GEX1	P25596	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	COS5	P47187	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YML6	P51998	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	COS7	Q07788	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	NDD1	Q08887	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YCR022C	P25620	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	DBF4	P32325	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	RTT107	P38850	1070 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SKO1	Q02100	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	DON1	Q05610	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	AFI1	Q99222	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SIN3	P22579	1536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	CLB1	P24868	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SPC110	P32380	944 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	NDC1	P32500	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	RFC3	P38629	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	HAT2	P39984	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	PAN1	P32521	1480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ERV1	P27882	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	GWT1	P47026	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	RTT101	P47050	842 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	YGL138C	P53122	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ARK1	P53974	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	KRE2	P27809	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ATS1	P31386	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SIN4	P32259	974 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	REC114	P32841	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	PTR2	P32901	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	CBP4	P37267	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	VHC1	P38329	1120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	TCB2	P48231	1178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	HSP31	Q04432	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	MDM30	Q05930	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	VAM3	Q12241	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ISA2	Q12425	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	HOM3	P10869	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	CPR2	P23285	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ARA1	P38115	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	RPR2	P40571	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	TRS85	P46944	698 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	COS10	P52924	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	HIR2	P32480	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SHO1	P40073	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	SAS2	P40963	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	ELP2	P42935	788 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	AIM32	Q04689	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	AYT1	Q12226	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HER2	YMR293C	HSP42	Q12329	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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