RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.89	□□□□□ -1.79	not detected
PAM18	YLR008C	BRO1	P48582	844 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	FMS1	P50264	508 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	EXG2	P52911	562 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	MPS2	P53159	387 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TAM41	P53230	385 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TWF1	P53250	332 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SRL4	Q03085	281 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	BNA7	Q04066	261 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ERV41	Q04651	352 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	STP3	Q05937	343 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	CTS2	Q06350	511 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YFH1	Q07540	174 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	NUS1	Q12063	375 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YOR022C	Q12204	715 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PDR18	P53756	1333 aa		3.89	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	GAL4	P04386	881 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PET122	P10355	254 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SEC63	P14906	663 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SAG1	P20840	650 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	UTR1	P21373	530 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ZIP1	P31111	875 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SPR1	P32603	445 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	CYM1	P32898	989 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PPS1	P38148	807 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	END3	P39013	349 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	RCY1	P39531	840 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	NUP60	P39705	539 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	FMC1	P40491	155 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	FKH2	P41813	862 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	HXT14	P42833	540 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	GSM1	P42950	618 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YJL132W	P47014	750 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	LOH1	P47055	219 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	NPA3	P47122	385 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YGL114W	P53134	725 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PEF1	P53238	335 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	HDA1	P53973	706 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	WAR1	Q03631	944 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ARP10	Q04549	284 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SPC2	Q04969	178 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	VTA1	Q06263	330 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ATG23	Q06671	453 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TPO1	Q07824	586 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	BSC6	Q08280	497 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	THI21	Q08975	551 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PUS9	Q12069	462 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TIP41	Q12199	356 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	FMP16	Q12497	93 aa		3.88	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	GAL3	P13045	520 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	IME1	P21190	360 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PEX1	P24004	1043 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ADH7	P25377	361 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	RAD14	P28519	371 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	MTC7	P32633	139 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	APT2	P36973	181 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	POP7	P38291	140 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	SWC5	P38326	303 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	FAD1	P38913	306 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	PZF1	P39933	429 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	AGE2	P40529	298 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	CEP3	P40969	608 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YJL107C	P42947	387 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	CTK2	P46962	323 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	NMD5	P46970	1048 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YHC3	P47040	408 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	CTR1	P49573	406 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	DIA3	P52290	468 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	TRS31	Q03337	283 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ACL4	Q03771	387 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ARG7	Q04728	441 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ADY4	Q05955	493 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	DUS4	Q06063	367 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	ATG17	Q06410	417 aa		3.87	□□□□□ -1.79
PAM18	YLR008C	GPN3	Q06543	272 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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