RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	MAC1	P35192	417 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SKG1	P36169	355 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YBR241C	P38142	488 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	BMT2	P38278	337 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	HSE1	P38753	452 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	UBA4	P38820	440 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YHR218W	P38899	603 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	DUN1	P39009	513 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RBG1	P39729	369 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	MEP2	P41948	499 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	ELP2	P42935	788 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YGL176C	P46945	554 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RMR1	P53060	241 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	IRC15	Q02733	499 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	CCE1	Q03702	353 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YLL007C	Q07799	665 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	PER33	Q12144	273 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	GLO4	Q12320	285 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	JLP1	Q12358	412 aa		6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SIR1	P21691	654 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	EPT1	P22140	391 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	KIN3	P22209	435 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	CMK2	P22517	447 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	PEX3	P28795	441 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	ATO2	P32907	282 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	FTH1	P38310	465 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	MOB1	P40484	314 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	CAB2	P40506	365 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	VHR1	P40522	640 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	AGP3	P43548	558 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	GAT1	P43574	510 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	PTR3	P43606	678 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	VEL1	P53058	206 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SWC4	P53201	476 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YNR065C	P53751	1116 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	MET31	Q03081	177 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	LOT6	Q07923	191 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SOG2	Q08817	791 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	GET4	Q12125	312 aa		6.35	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	PHO5	P00635	467 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	MRP13	P12686	339 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	REV1	P12689	985 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	CNA1	P23287	553 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	DMC1	P25453	334 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RSC6	P25632	483 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	ATP11	P32453	318 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	CDC5	P32562	705 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SPC34	P36131	295 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YCR087C-A	P37263	153 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SAF1	P38352	637 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	DBP8	P38719	431 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RIC1	P40395	1056 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	GAB1	P41733	394 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	FLC3	P53121	802 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	ENT2	Q05785	613 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	GPI11	Q06636	219 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	RSA1	Q08932	381 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YDR056C	Q12025	205 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	VIK1	Q12045	647 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	PST1	Q12355	444 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	SNF8	Q12483	233 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		6.34	□□□□□ -1.39
MIA40	YKL195W	FLP1	P03870	423 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	STE3	P06783	470 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	COR1	P07256	457 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	KAR1	P11927	433 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MET8	P15807	274 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TYR1	P20049	452 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	FAR1	P21268	830 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	POL4	P25615	582 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GLG1	P36143	616 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	GIC1	P38785	314 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	TIM17	P39515	158 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	MTW1	P39731	289 aa		6.33	□□□□□ -1.4
MIA40	YKL195W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4

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