RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	RAX1	Q08760	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	FEX1	Q08913	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NBP2	Q12163	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ATG34	Q12292	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ATG31	Q12421	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SNF5	P18480	905 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PEX34	P25584	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PMT2	P31382	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ACH1	P32316	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HXT1	P32465	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RRN3	P36070	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YBR056W	P38081	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ATG7	P38862	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RTS2	P40962	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YNL320W	P42840	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	COS4	P43542	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	IRC6	P43615	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ASK10	P48361	1146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MNT2	P53059	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	COS1	P53822	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	REC102	Q02721	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SPC2	Q04969	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NDE2	Q07500	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SIF2	YBR103W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ARP7	Q12406	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPN13	O13563	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MRP13	P12686	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HXT2	P23585	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RER1	P25560	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YKL097C	P34245	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TAF14	P35189	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CLG1	P35190	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	STB6	P36085	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ECM31	P38122	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	AGE2	P40529	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BNA6	P43619	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GUF1	P46943	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TEP1	P53916	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SPC19	Q03954	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ECI1	Q05871	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BCP1	Q06338	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	IRC10	Q08118	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	AVL9	Q12500	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	STE12	P13574	688 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HOP1	P20050	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PEX3	P28795	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ARA1	P38115	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DUG2	P38149	878 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PPE1	P38796	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SPC97	P38863	823 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MSE1	P48525	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NAS6	P50086	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SSY1	Q03770	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SMP3	Q04174	516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PEX10	Q05568	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SWA2	Q06677	668 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	LCB4	Q12246	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HMS1	Q12398	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BI2	P03873	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	HIS5	P07172	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PPH22	P23595	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	RSC6	P25632	483 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	DAL80	P26343	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	DOA4	P32571	926 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	TFB1	P32776	642 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	VAM7	P32912	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SIF2	YBR103W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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