RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 TCTN1Q2MV58 587 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.63■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 LY6KQ17RY6 165 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 SESTD1Q86VW0 696 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 MYOCDQ8IZQ8 938 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.62■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 SIP14410 1827 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 AMHP03971 560 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 USH1GQ495M9 461 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 DGKDQ16760 1214 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 TIGD5Q53EQ6 642 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNH6Q9H252 994 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 PSEN2P49810 448 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 BANK1Q8NDB2 785 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 NEK9Q8TD19 979 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 KAT2BQ92831 832 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM47Q9BQJ4 181 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 LGR5O75473 907 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP1Q07960 439 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 RBL2Q08999 1139 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 PTK7Q13308 1070 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.58■■□□□ 1.69
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CAPNS1-205ENST00000588780 MFSD10Q14728 455 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 EPC2Q52LR7 807 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 YME1L1Q96TA2 773 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF286BP0CG31 522 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 TCEAL5Q5H9L2 206 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 SAMD11Q96NU1 681 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 CLDND1Q9NY35 253 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 POTEB3A0JP26 581 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 PDHBP11177 359 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ZP2Q05996 745 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 STXBP2Q15833 593 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 POTEBQ6S5H4 581 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 DBF4BQ8NFT6 615 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 SNX27Q96L92 541 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 EMSYQ7Z589 1322 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ORC4O43929 436 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 UPP2O95045 317 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 THPOP40225 353 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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CAPNS1-205ENST00000588780 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 NOVP48745 357 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF543Q08ER8 600 aa25.53■■□□□ 1.68
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CAPNS1-205ENST00000588780 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 WNT8BQ93098 351 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 RSPH10BP0C881 870 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 RGS22Q8NE09 1264 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-205ENST00000588780 RMDN3Q96TC7 470 aa25.52■■□□□ 1.68
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CAPNS1-205ENST00000588780 H3BNC9 293 aa25.51■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM192Q8IY95 271 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.51■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 IRS1P35568 1242 aa25.5■■□□□ 1.67
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CAPNS1-205ENST00000588780 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D5Q92609 795 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKS1AQ92625 1134 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 IWS1Q96ST2 819 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXP2O15409 715 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 F2P00734 622 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 RPAINQ86UA6 219 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO11Q86XK2 927 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-205ENST00000588780 MIER1Q8N108 512 aa25.49■■□□□ 1.67
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