RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 ABL1P00519 1130 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF18P17022 549 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS6KA1Q15418 735 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 MAN2A1Q16706 1144 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 MMS19Q96T76 1030 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 ESYT3A0FGR9 886 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 CLRN2A0PK11 232 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC53A6NM62 1247 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PLA2G4AP47712 749 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT12Q99456 494 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFAB1O14561 156 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 VWA3BQ502W6 1294 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.11□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEB3A0JP26 581 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 POTECB2RU33 542 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 SORBS3O60504 671 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 RASA1P20936 1047 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNJ6P48051 423 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEBQ6S5H4 581 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 JCADQ9P266 1359 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 LAD1O00515 517 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOC3O60645 756 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS72Q15906 364 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNC1P63316 161 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 GRIK5Q16478 980 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PEX26Q7Z412 305 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 BICD1Q96G01 975 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 SLURP2P0DP57 97 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PNKPQ96T60 521 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 DPH5Q9H2P9 285 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 BCS1LQ9Y276 419 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF1AQ12756 1690 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 DAAM2Q86T65 1068 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 PLA2G4BP0C869 781 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO11Q86XK2 927 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 CUEDC2Q9H467 287 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 STXBP3O00186 592 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 IFT20Q8IY31 132 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 EHD2Q9NZN4 543 aa14.09□□□□□ -0.15
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEFA5A3E0 1075 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 MYMKA6NI61 221 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC169A6NNP5 214 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEIP0CG38 1075 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFAIP3P21580 790 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEGQ6S5H5 508 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D8O95759 1140 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP10P09238 476 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 GNGT1P63211 74 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR78Q5VTH9 848 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRN2O75325 713 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 NEFHP12036 1026 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 BARGINQ6ZT62 677 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC51AQ86UW1 340 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.08□□□□□ -0.16
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.6 ms