RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245105.7

SH3TC1-201, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SH3TC1, Length 4,226 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1-201ENST00000245105 CHMP2AO43633 222 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 DDAH1O94760 285 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 A6NNZ2 444 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 MYZAPP0CAP1 466 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 PAX7P23759 505 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 DLGAP5Q15398 846 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 TRIM58Q8NG06 486 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 GSDMAQ96QA5 445 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 CSF1RP07333 972 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 CALCRLQ16602 461 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 LY9Q9HBG7 655 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 LSP1P33241 339 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 KRT12Q99456 494 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 CPVLQ9H3G5 476 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 STIM2Q9P246 746 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 SEMA3EO15041 775 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 CNPY4Q8N129 248 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3TC1-201ENST00000245105 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 TEKT1Q969V4 418 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 NAA35Q5VZE5 725 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 NLRP14Q86W24 1093 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 LACRTQ9GZZ8 138 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PDHBP11177 359 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CUL4BQ13620 913 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 ZIM3Q96PE6 472 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 MAP3K14Q99558 947 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SP4Q02446 784 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PPP1R37O75864 691 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CPP00450 1065 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 GYS1P13807 737 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 KRT71Q3SY84 523 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 RRAGAQ7L523 313 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SATB1Q01826 763 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 SULF1Q8IWU6 871 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 IFT172Q9UG01 1749 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 FAM13AO94988 1023 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 PSEN1P49768 467 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 ALS2CLQ60I27 953 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3TC1-201ENST00000245105 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms