RNA–Protein interactions for RNA: YMR293C

HER2, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene HER2, Length 1,395 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HER2	YMR293C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YGL108C	P53139	140 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	SLD5	Q03406	294 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	NUP53	Q03790	475 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RBA50	Q04418	439 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	VTA1	Q06263	330 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RRD2	Q12461	358 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	BNI1	P41832	1953 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	APE1	P14904	514 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	UTR4	P32626	227 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YEH2	Q07950	538 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YAP7	Q08182	245 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RAV1	P47104	1357 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	ATP11	P32453	318 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
HER2	YMR293C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RPM2	Q02773	1202 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	CSR2	Q12734	1121 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	ISN1	Q99312	450 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YML133C	Q03099	1374 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YLL067C	Q07888	1374 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YLL066C	Q99208	1374 aa		5	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	DNF1	P32660	1571 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	CLC1	P17891	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	ADK2	P26364	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RAD14	P28519	371 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	CUL3	P53202	744 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	PHO92	Q06390	306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	SYO1	Q07395	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RHO2	P06781	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	SEC62	P21825	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	BZZ1	P38822	633 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YGR149W	P48236	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	YGL082W	P53155	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	IVY1	Q04934	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	UFD4	P33202	1483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	PPZ1	P26570	692 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RML2	P32611	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	TRS65	P32893	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	TUL1	P36096	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RIM2	P38127	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	VPS52	P39904	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HER2	YMR293C	CHD1	P32657	1468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SPS4	P09937	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	MRS3	P10566	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	PPH22	P23595	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YCR051W	P25631	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YIM1	P28625	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	FRE1	P32791	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SYG1	P40528	902 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SNM1	P40993	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	GPI1	P53306	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	ERP4	Q12450	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	ATP10	P18496	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	AFG1	P32317	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	HCS1	P34243	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	URB2	P47108	1174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RPO31	P04051	1460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	GYP6	P32806	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	THI2	P38141	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	FAU1	P40099	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YJL068C	P40363	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	SOV1	Q04748	898 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	GRS2	Q06817	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HER2	YMR293C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
HER2	YMR293C	RKM5	Q12367	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.1 ms