RNA–Protein interactions for RNA: YKL108W

SLD2, Transcript of Single-stranded DNA origin-binding and annealing protein, yeast

Gene SLD2, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLD2	YKL108W	SHP1	P34223	423 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	YLR455W	Q06188	304 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
SLD2	YKL108W	RAV1	P47104	1357 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	RHO2	P06781	192 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	ERV46	P39727	415 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	YJL043W	P47053	257 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	PIB2	P53191	635 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	GRX3	Q03835	250 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	YFH1	Q07540	174 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	SUT2	Q12286	268 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SLD2	YKL108W	CBP1	P07252	654 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PUT2	P07275	575 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	GAL7	P08431	366 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SNF3	P10870	884 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PMR1	P13586	950 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MSS51	P32335	436 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	VPS17	P32913	551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	CDC1	P40986	491 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ELP2	P42935	788 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SNG1	P46950	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	TOM22	P49334	152 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ALF1	P53904	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SLG1	P54867	378 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	KIN4	Q01919	800 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	GIS1	Q03833	894 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MRPL1	Q04599	285 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	RIP1	P08067	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	GPA1	P08539	472 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ATP10	P18496	279 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	RHB1	P25378	209 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	IME2	P32581	645 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MRPL40	P36534	297 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ROT2	P38138	954 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ARP1	P38696	384 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	EFM3	P47163	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ATG26	Q06321	1198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	KIN3	P22209	435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	CTS1	P29029	562 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	BNA4	P38169	460 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PCA1	P38360	1216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	YHR210C	P38893	341 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	STB4	P50104	949 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PRM1	P53835	661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ARP5	P53946	755 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PDR8	Q06149	701 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	BI2	P03873	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ALG1	P16661	449 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	NUP1	P20676	1076 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MAK32	P23060	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	GEX1	P25596	615 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	KRE2	P27809	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	NDI1	P32340	513 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	RPC34	P32910	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MIA40	P36046	403 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MNL1	P38888	796 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	YIL060W	P40519	144 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	POP1	P41812	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	NMD5	P46970	1048 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ROG1	P53118	685 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	BUD32	P53323	261 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	POS5	Q06892	414 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	ACF2	Q12168	779 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	CEX1	Q12453	761 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SMC4	Q12267	1418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	COX3	P00420	269 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	YMC1	P32331	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	MSN2	P33748	704 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLD2	YKL108W	TRM2	P33753	639 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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