RNA–Protein interactions for RNA: YHR192W

LNP1, Transcript of Lunapark family member involved in ER network formation, yeast

Gene LNP1, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LNP1	YHR192W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	NMD5	P46970	1048 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ECM27	P47144	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PLM2	Q04383	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MSC3	Q05812	728 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ATG9	Q12142	997 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	LCB4	Q12246	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	CHD1	P32657	1468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	RAV1	P47104	1357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ERG11	P10614	530 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PMR1	P13586	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	HNM1	P19807	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	HIR2	P32480	875 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ECM25	P32525	599 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	GDA1	P32621	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MRP4	P32902	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YBL028C	P38202	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YER130C	P39959	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PMT6	P42934	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YHC3	P47040	408 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	EFM3	P47163	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	SMA1	Q02651	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	VPS20	Q04272	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	GSH2	Q08220	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	SSK2	P53599	1579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PCT1	P13259	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PET18	P25362	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	RDS1	P25611	832 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	CAB3	P36076	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	GLG1	P36143	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	VHC1	P38329	1120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	TSC10	P38342	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PEX18	P38855	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	SDS3	P40505	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	KEL2	P50090	882 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YIP5	P53108	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YGL108C	P53139	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PIB2	P53191	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YGR266W	P53326	701 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	OCA2	P53949	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	TAP42	Q04372	366 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	COQ9	Q05779	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ARO10	Q06408	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	WHI2	P12611	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	BEM1	P29366	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	COY1	P34237	679 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	TOM22	P49334	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YGR126W	P53274	230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ATG4	P53867	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YNL092W	P53934	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ECM18	Q04623	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	RRT8	Q08219	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	LAM4	P38800	1345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	VPS63	O13549	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	COR1	P07256	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PUT2	P07275	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	PET111	P08468	800 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	RAP1	P11938	827 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	STE4	P18851	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	REC114	P32841	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MRPL37	P36532	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	YPT10	P38146	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	MSG5	P38590	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LNP1	YHR192W	CTM1	P38818	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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