RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W FMO1P38866 432 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ACO2P39533 789 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GAB1P41733 394 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W IBA57P47158 497 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W AIM14P53109 570 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TNA1P53322 534 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SED5Q01590 340 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MRPL13Q02204 264 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SCS7Q03529 384 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ACL4Q03771 387 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W BCP1Q06338 283 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W OPT2Q06593 877 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDL086WQ07505 273 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RSB1Q08417 382 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDR061WQ12298 539 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ZRT2Q12436 422 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TRM11Q12463 433 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HCM1P25364 564 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SED4P25365 1065 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W LAC1P28496 418 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CTS1P29029 562 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CAM1P29547 415 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SFP1P32432 683 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YGL015CP33199 130 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SOF1P33750 489 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HES1P35843 434 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YBR139WP38109 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DSE1P40077 573 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W KHA1P40309 873 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RFC2P40348 353 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PMT3P47190 753 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HLJ1P48353 224 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W EOS1P53938 366 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MTQ1P53944 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HED1Q03937 162 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ECM18Q04623 453 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W THI7Q05998 598 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YPR127WQ06494 345 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CDA2Q06703 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YPR063CQ12160 140 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YOR114WQ12219 294 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ISN1Q99312 450 aa5.05□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DST1P07273 309 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W EMC1P25574 760 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SCM4P32564 187 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YBR259WP38338 688 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MSC7P38694 644 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GPB2P39717 880 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ERV46P39727 415 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GPP2P40106 250 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W KTR7P40504 517 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PUS4P48567 403 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PMT5P52867 743 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DOC1P53068 250 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YGL108CP53139 140 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YAP1802P53309 568 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YDL176WQ12027 708 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TSC13Q99190 310 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HTB1P02293 131 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W HTB2P02294 131 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W RAM1P22007 431 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data5.04□□□□□ -1.6not detected
CYK3YDL117W SER1P33330 395 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W OAR1P35731 278 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W PYK2P52489 506 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W DRN1P53255 507 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YGR250CP53316 781 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W UME1Q03010 460 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SLD5Q03406 294 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ARA2Q04212 335 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SEG1Q04279 960 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NSL1Q12143 216 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W AGC1Q12482 902 aa5.04□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YPK1P12688 680 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TOP3P13099 656 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SRV2P17555 526 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W GRX2P17695 143 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W KAP122P32767 1081 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W EAP1P36041 632 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MRPL3P36516 390 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W ECM13P38195 257 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NAS2P40555 220 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CAF16P43569 289 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W SIP4P46954 829 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W LYS20P48570 428 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W CTF18P49956 741 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W IMA1P53051 589 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W NPY1P53164 384 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TDA9Q04545 1251 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W YLR283WQ05867 314 aa5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CYK3YDL117W MFG1Q07684 458 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.3 ms