RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	ORC3	P54790	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RMI1	Q02685	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ACL4	Q03771	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BNA7	Q04066	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SOV1	Q04748	898 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	LOT6	Q07923	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SGT1	Q08446	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DAS2	Q12084	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HRT3	Q12347	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RTR2	Q12378	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SIF2	YBR103W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	STF2	P16965	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SPO12	P17123	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DAL2	P25335	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PPZ1	P26570	692 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YKR051W	P36142	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SIF2	P38262	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GIC1	P38785	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SFB3	P38810	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ELP2	P42935	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YFL054C	P43549	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPC17	P47076	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YGR067C	P53243	804 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HOL1	P53389	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GCN5	Q03330	439 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HER2	Q03557	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TRE1	Q08919	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	VCX1	Q99385	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DSS4	P32601	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YSC84	P32793	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MDJ1	P35191	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RFC3	P38629	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SIF2	YBR103W	FHL1	P39521	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	AIM2	P39721	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	VFA1	P40080	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NDE1	P40215	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PHO86	P46956	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MND1	P53102	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MPS1	P54199	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TPP1	Q03796	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TAF11	Q04226	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RAD33	Q04231	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PRM6	Q04705	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CRR1	Q05790	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BLS1	Q06071	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	FAB1	P34756	2278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BET2	P20133	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PDE1	P22434	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YCL002C	P25565	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BEM3	P32873	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MRP4	P32902	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ALG14	P38242	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SLM4	P38247	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CCZ1	P38273	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YBR138C	P38277	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	APE4	P38821	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SEN34	P39707	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SAW1	P39735	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ERR3	P42222	437 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BIR1	P47134	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DID2	P69771	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PET117	Q02771	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RAD30	Q04049	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	VTA1	Q06263	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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