RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D8	O95759	1140 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	SHMT1	P34896	483 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RASSF10	A6NK89	507 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	KRT79	Q5XKE5	535 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CEP112	Q8N8E3	955 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	SNHG28	P0DPA3	235 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	HERVK_113	P62684	666 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CYP27A1	Q02318	531 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	MIIP	Q5JXC2	388 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L15	C9J2P7	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L11	C9JVI0	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L18	D6R9N7	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L22	D6RA61	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L19	D6RCP7	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L20	D6RJB6	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L24	Q0WX57	530 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ECM1	Q16610	540 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1328	Q86T90	577 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	PROM2	Q8N271	834 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	DDX12P	Q92771	950 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RAB34	Q9BZG1	259 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DOA	P06340	250 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CUL5	Q93034	780 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	TEKT1	Q969V4	418 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	PNKP	Q96T60	521 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	MYO6	Q9UM54	1294 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RCCD1	A6NED2	376 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	SRGAP2	O75044	1071 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CTAGE8	P0CG41	777 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	UNC13D	Q70J99	1090 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	RAD54L	Q92698	747 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BRF1-222	ENST00000635152	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	SNAP25	P60880	206 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	CENPP	Q6IPU0	288 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	HAS1	Q92839	578 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	STK17A	Q9UEE5	414 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB5	O15062	677 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	EPHB6	O15197	1021 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	ZBED6	P86452	979 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	14.58	□□□□□ -0.08	3e-8	■□□□□ 10.7
BRF1-222	ENST00000635152	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	SWAP70	Q9UH65	585 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		14.58	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA3F	Q13275	785 aa		14.57	□□□□□ -0.08
BRF1-222	ENST00000635152	MSL1	Q68DK7	614 aa		14.57	□□□□□ -0.08

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