RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 OPLAHO14841 1288 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 HIP1RO75146 1068 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 XBP1P17861 261 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 KLC1Q07866 573 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 KIFAP3Q92845 792 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PANX2Q96RD6 677 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SETDB2Q96T68 719 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 NDNQ99608 321 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.043e-6■■■□□ 15
EFTUD2-218ENST00000590367 NARFQ9UHQ1 456 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ASB3Q9Y575 518 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 DNM1LO00429 736 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LMNB2Q03252 620 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PTH1RQ03431 593 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GCKRQ14397 625 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 HOOK3Q86VS8 718 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SLF2Q8IX21 1173 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 IFT74Q96LB3 600 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GBP5Q96PP8 586 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SCOCQ9UIL1 159 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 NCAPD2Q15021 1401 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LARGE1O95461 756 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CA8P35219 290 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FANCLQ9NW38 375 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM221A6NGB7 291 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GUCY1A3Q02108 690 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 EMC10Q5UCC4 262 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GALNT17Q6IS24 598 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PREBQ9HCU5 417 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 H0YIN7 160 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 IDO1P14902 403 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC25CP30307 473 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TGFB2P61812 414 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TFCP2Q12800 502 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 USH1GQ495M9 461 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 AGAP11Q8TF27 550 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 CORO1BQ9BR76 489 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 COL15A1P39059 1388 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GVG6 124 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV5-2P06315 115 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 RESTQ13127 1097 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MAP7Q14244 749 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CNBD1Q8NA66 436 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC197Q8NCU1 140 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 MIS12Q9H081 205 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SENP2Q9HC62 589 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 PAK2Q13177 524 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC51Q96ER9 411 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 CETN3O15182 167 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 BCRP11274 1271 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-218ENST00000590367 NEK2P51955 445 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms