RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 DEFB118Q96PH6 123 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 RNF146Q9NTX7 359 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 HSD17B4P51659 736 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 GPR153Q6NV75 609 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MYH6P13533 1939 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 B4DLN1 442 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 M0R2N6 131 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 F13A1P00488 732 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 TRAPPC10P48553 1259 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NPY5RQ15761 445 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MCTP1Q6DN14 999 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 Q7L0L9 218 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.37□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 BTBD18B2RXH4 712 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MEIS2O14770 477 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 OPLAHO14841 1288 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CFBP00751 764 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 FCER1AP12319 257 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ERCC3P19447 782 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 GUCY1B3Q02153 619 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 KCTD2Q14681 263 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 Q3C1V9 767 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 RILPL1Q5EBL4 403 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 XRRA1Q6P2D8 792 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 DNERQ8NFT8 737 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF25Q93038 417 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PCDHA6Q9UN73 950 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 RIPK3Q9Y572 518 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 RESTQ13127 1097 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MUM1L1Q5H9M0 696 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PXYLP1Q8TE99 480 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 SLC15A5A6NIM6 579 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NFIBO00712 420 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 DTNBO60941 627 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 BMP15O95972 392 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 BMP8BP34820 402 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 USP11P51784 963 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 FOSBP53539 338 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 NSMFQ6X4W1 530 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 IWS1Q96ST2 819 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MMP19Q99542 508 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 GDF15Q99988 308 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 HOMER2Q9NSB8 354 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 CFAP45Q9UL16 551 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 ALPK3Q96L96 1907 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-211ENST00000488243 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 STAM2O75886 525 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 CYP3A4P08684 503 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 PTPREP23469 700 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 SREBF1P36956 1147 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 NR5A1Q13285 461 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 IRF5Q13568 498 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-211ENST00000488243 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms