RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413164.6

SLC13A3-204, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC13A3, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-204ENST00000413164 PDE4DQ08499 809 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 STK4Q13043 487 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 EXOC1Q9NV70 894 aa23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CASP14P31944 242 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 SV2BQ7L1I2 683 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CNGA4Q8IV77 575 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 PPP1R2P41236 205 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC51Q96ER9 411 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 VPS33BQ9H267 617 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L15C9J2P7 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L11C9JVI0 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L18D6R9N7 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L22D6RA61 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L19D6RCP7 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L20D6RJB6 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 FANCGO15287 622 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 NDUFB10O96000 172 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L24Q0WX57 530 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CNNM4Q6P4Q7 775 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 MYMKA6NI61 221 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 RAD21O60216 631 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CCNE1P24864 410 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 P2RX5Q93086 422 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 TRIM47Q96LD4 638 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 CSRNP1Q96S65 589 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 GMLQ99445 158 aa23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3-204ENST00000413164 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 NFKBIEO00221 500 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 MEIS2O14770 477 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 GH2P01242 217 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 SPDYE6P0CI01 402 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 FCER1AP12319 257 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 USP11P51784 963 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 MCM6Q14566 821 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 KRT79Q5XKE5 535 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 RAD54LQ92698 747 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 MBOAT7Q96N66 472 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP3A7P24462 503 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 TRIM14Q14142 442 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 MTF1Q14872 753 aa23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 COL4A5P29400 1685 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 BICDL2A1A5D9 508 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 LGALS16A8MUM7 142 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 RAD9BQ6WBX8 426 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 UNC13DQ70J99 1090 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 NIM1KQ8IY84 436 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 AMNQ9BXJ7 453 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 ANO3Q9BYT9 981 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 DNAI1Q9UI46 699 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 A0A1W2PQC6 194 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 RASSF7Q02833 373 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 AP3B2Q13367 1082 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 HYIQ5T013 277 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 KCNK18Q7Z418 384 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 A0A1W2PRG0 241 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 MMP14P50281 582 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 UBXN1Q04323 297 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 ECM1Q16610 540 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3-204ENST00000413164 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.36■■□□□ 1.33
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