RNA–Protein interactions for RNA: YHR089C

GAR1, Transcript of Protein component of the H/ACA snoRNP pseudouridylase complex, yeast

Gene GAR1, Length 618 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAR1	YHR089C	PSK1	P31374	1356 aa		19.06	■□□□□ 0.64
GAR1	YHR089C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
GAR1	YHR089C	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
GAR1	YHR089C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
GAR1	YHR089C	MHP1	P43638	1398 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GAR1	YHR089C	YML133C	Q03099	1374 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GAR1	YHR089C	YLL067C	Q07888	1374 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GAR1	YHR089C	YLL066C	Q99208	1374 aa		18.87	■□□□□ 0.61
GAR1	YHR089C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
GAR1	YHR089C	FKH1	P40466	484 aa		18.85	■□□□□ 0.61
GAR1	YHR089C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	APP1	P53933	587 aa		18.83	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		18.82	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	TY4B-J	P47024	1803 aa		18.82	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	REB1	P21538	810 aa		18.81	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	PDS5	Q04264	1277 aa		18.78	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	ENT1	Q12518	454 aa		18.77	■□□□□ 0.6
GAR1	YHR089C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
GAR1	YHR089C	RTG3	P38165	486 aa		18.75	■□□□□ 0.59
GAR1	YHR089C	CSE4	P36012	229 aa		18.71	■□□□□ 0.59
GAR1	YHR089C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
GAR1	YHR089C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
GAR1	YHR089C	ENV9	Q08651	330 aa		18.7	■□□□□ 0.58
GAR1	YHR089C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
GAR1	YHR089C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
GAR1	YHR089C	YRF1-2	P40105	1681 aa		18.61	■□□□□ 0.57
GAR1	YHR089C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
GAR1	YHR089C	TAP42	Q04372	366 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GAR1	YHR089C	SLM3	Q12093	417 aa		18.59	■□□□□ 0.57
GAR1	YHR089C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
GAR1	YHR089C	RTF1	P53064	558 aa		18.57	■□□□□ 0.56
GAR1	YHR089C	TCB1	Q12466	1186 aa		18.54	■□□□□ 0.56
GAR1	YHR089C	AUS1	Q08409	1394 aa		18.53	■□□□□ 0.56
GAR1	YHR089C	GRX4	P32642	244 aa		18.52	■□□□□ 0.56
GAR1	YHR089C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	YIL177C	P40434	1758 aa		18.51	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	YJL225C	P40889	1758 aa		18.51	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	NST1	P53935	1240 aa		18.5	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	GAS4	Q08271	471 aa		18.5	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	RSF2	P46974	1380 aa		18.5	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	HIM1	Q06674	414 aa		18.46	■□□□□ 0.55
GAR1	YHR089C	IES2	P40154	320 aa		18.45	■□□□□ 0.54
GAR1	YHR089C	XKS1	P42826	600 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GAR1	YHR089C	SPT7	P35177	1332 aa		18.41	■□□□□ 0.54
GAR1	YHR089C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GAR1	YHR089C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
GAR1	YHR089C	APC1	P53886	1748 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	FKS3	Q04952	1785 aa		18.39	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	TRK1	P12685	1235 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	YMR074C	Q04773	145 aa		18.38	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	YRF1-6	P53819	1859 aa		18.37	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.53
GAR1	YHR089C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	LEU3	P08638	886 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	DOT5	P40553	215 aa		18.31	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	SIR4	P11978	1358 aa		18.3	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	RCR1	P38212	213 aa		18.29	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	YKL133C	P36066	463 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	IOC4	Q04213	475 aa		18.27	■□□□□ 0.52
GAR1	YHR089C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GAR1	YHR089C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
GAR1	YHR089C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.22	■□□□□ 0.51	not detected
GAR1	YHR089C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	MEC3	Q02574	474 aa		18.2	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	DSD1	P53095	428 aa		18.19	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	YRF1-4	O13559	1382 aa		18.16	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	SNF2	P22082	1703 aa		18.15	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	EDE1	P34216	1381 aa		18.15	■□□□□ 0.5
GAR1	YHR089C	COB	P00163	385 aa		18.14	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	CTF4	Q01454	927 aa		18.13	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	YKR075C	P36155	307 aa		18.12	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	18.11	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	LAM6	Q08001	693 aa		18.09	■□□□□ 0.49
GAR1	YHR089C	UBP1	P25037	809 aa		18.08	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	NPR2	P39923	615 aa		18.06	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	YJL181W	P46987	611 aa		18.05	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	PRI1	P10363	409 aa		18.04	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	NTH2	P35172	780 aa		18.04	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	NUP145	P49687	1317 aa		18.03	■□□□□ 0.48
GAR1	YHR089C	PRD1	P25375	712 aa		18.03	■□□□□ 0.48

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