RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	TRK1	P12685	1235 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	RRN6	P32786	894 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	YTA7	P40340	1379 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	ALD2	P47771	506 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	YPL062W	Q02781	134 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	AI4	P03878	556 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	TTI1	P36097	1038 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	TPO2	P53283	614 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	MPH3	P0CE00	602 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	PUP1	P25043	261 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	VHR2	P40041	505 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	YML083C	Q04526	418 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	KEX1	P09620	729 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	BIO2	P32451	375 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	ATE1	P16639	503 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	MRX10	Q05648	414 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	STB3	Q12427	513 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
AI2	Q0055	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	YJL007C	P47080	104 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
AI2	Q0055	MPC54	Q08550	464 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	AMS1	P22855	1083 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	RAD54	P32863	898 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	TAT2	P38967	592 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	IPL1	P38991	367 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	WHI5	Q12416	295 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	CPS1	P27614	576 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	HEM3	P28789	327 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	PEP12	P32854	288 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	NMA111	P53920	997 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AI2	Q0055	RSC30	P38781	883 aa		3.84	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	SLI15	P38283	698 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	KIC1	P38692	1080 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	ORC6	P38826	435 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	BUD6	P41697	788 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	GYP1	Q08484	637 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	YPR015C	Q12531	247 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	MDJ2	P42834	146 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	IOC3	P43596	787 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	CST6	P40535	587 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	CSN12	P47130	423 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	RIM21	P48565	533 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	DPL1	Q05567	589 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	YJR107W	P47145	328 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	UBX5	Q06682	500 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	RAM1	P22007	431 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	BRN1	P38170	754 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	YAF9	P53930	226 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AI2	Q0055	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	RGR1	P19263	1082 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	MET10	P39692	1035 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	RTF1	P53064	558 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	CSC1	Q06538	782 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	HAT1	Q12341	374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	ERP5	P38819	212 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	SAS4	Q04003	481 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	CDC73	Q06697	393 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	CIT2	P08679	460 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.76	□□□□□ -1.81	not detected
AI2	Q0055	NIS1	P53939	407 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	MET4	P32389	672 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	PPM2	Q08282	695 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	TFB4	Q12004	338 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	SIT4	P20604	311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	TGL4	P36165	910 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	ATF2	P53296	535 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	ISU2	Q12056	156 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	KTR2	P33550	425 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	BRL1	P38770	471 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	GPI13	Q07830	1017 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	SDH2	P21801	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AI2	Q0055	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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