RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641949.1

MFSD8-256, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-256	ENST00000641949	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		12.13	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	METRN	Q9UJH8	293 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		12.11	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	SYNJ2	O15056	1496 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	IGF1R	P08069	1367 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	TIE1	P35590	1138 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	IFNL1	Q8IU54	200 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	PBRM1	Q86U86	1689 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MFSD8-256	ENST00000641949	KLHL34	Q8N239	644 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	SLC39A7	Q92504	469 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	C7	P10643	843 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	POTEF	A5A3E0	1075 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	PYGB	P11216	843 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	CHD1	O14646	1710 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	GRIN2A	Q12879	1464 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MFSD8-256	ENST00000641949	ADAMTS12	P58397	1594 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MFSD8-256	ENST00000641949	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
MFSD8-256	ENST00000641949	CUL7	Q14999	1698 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MFSD8-256	ENST00000641949	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MFSD8-256	ENST00000641949	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MFSD8-256	ENST00000641949	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MFSD8-256	ENST00000641949	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.96	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	EEA1	Q15075	1411 aa		11.96	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	NUP160	Q12769	1436 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	GSE1	Q14687	1217 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MFSD8-256	ENST00000641949	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	IER5L	Q5T953	404 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	SEC24B	O95487	1268 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MFSD8-256	ENST00000641949	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MFSD8-256	ENST00000641949	PSEN1	P49768	467 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	PTPRG	P23470	1445 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	KIF21B	O75037	1637 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	ST18	O60284	1047 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	PLCG2	P16885	1265 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	OCEL1	Q9H607	264 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MFSD8-256	ENST00000641949	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
MFSD8-256	ENST00000641949	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MFSD8-256	ENST00000641949	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MFSD8-256	ENST00000641949	KIAA0556	O60303	1618 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MFSD8-256	ENST00000641949	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	CABP2	Q9NPB3	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55	3e-9	■■■■□ 20.7
MFSD8-256	ENST00000641949	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.58	□□□□□ -0.55
MFSD8-256	ENST00000641949	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.58	□□□□□ -0.56
MFSD8-256	ENST00000641949	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MFSD8-256	ENST00000641949	CLIP1	P30622	1438 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MFSD8-256	ENST00000641949	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MFSD8-256	ENST00000641949	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MFSD8-256	ENST00000641949	ABCA8	O94911	1581 aa		11.54	□□□□□ -0.56

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