RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641332.1

MFSD8-222, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,759 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-222	ENST00000641332	TMTC2	Q8N394	836 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	CDCA8	Q53HL2	280 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	SOX12	O15370	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332		E9PSI1	815 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MFSD8-222	ENST00000641332	NACAD	O15069	1562 aa		10.4	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	NEFM	P07197	916 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MFSD8-222	ENST00000641332	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
MFSD8-222	ENST00000641332	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	PHF14	O94880	888 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	CLGN	O14967	610 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	IRF5	Q13568	498 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MFSD8-222	ENST00000641332	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	MARCH6	O60337	910 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	WIZ	O95785	1651 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	MPND	Q8N594	471 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	MMP14	P50281	582 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	NME8	Q8N427	588 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	RGL2	O15211	777 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MFSD8-222	ENST00000641332	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	RGS3	P49796	1198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	PEX14	O75381	377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	APP	P05067	770 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	IRF6	O14896	467 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	FOSB	P53539	338 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MFSD8-222	ENST00000641332	PSEN1	P49768	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	RGL3	Q3MIN7	710 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
MFSD8-222	ENST00000641332	POLD1	P28340	1107 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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