RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635747.1

CLN6-210, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-210ENST00000635747 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.24■■■□□ 2.27
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CLN6-210ENST00000635747 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.21■■■□□ 2.27
CLN6-210ENST00000635747 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.2■■■□□ 2.27
CLN6-210ENST00000635747 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.16■■■□□ 2.26
CLN6-210ENST00000635747 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.16■■■□□ 2.26
CLN6-210ENST00000635747 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.16■■■□□ 2.26
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CLN6-210ENST00000635747 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.12■■■□□ 2.25
CLN6-210ENST00000635747 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.12■■■□□ 2.25
CLN6-210ENST00000635747 AFAP1Q8N556 730 aa29.1■■■□□ 2.25
CLN6-210ENST00000635747 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.08■■■□□ 2.25
CLN6-210ENST00000635747 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.06■■■□□ 2.24
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CLN6-210ENST00000635747 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.35■■■□□ 2.13
CLN6-210ENST00000635747 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.35■■■□□ 2.13
CLN6-210ENST00000635747 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.34■■■□□ 2.13
CLN6-210ENST00000635747 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CLN6-210ENST00000635747 ABCC5O15440 1437 aa28.31■■■□□ 2.12
CLN6-210ENST00000635747 PTPRKQ15262 1439 aa28.31■■■□□ 2.12
CLN6-210ENST00000635747 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.31■■■□□ 2.12
CLN6-210ENST00000635747 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.28■■■□□ 2.12
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