RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621665.1

GRAMD4P3-201, Transcript of GRAM domain containing 4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene GRAMD4P3, Length 1,669 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.6■■□□□ 1.69
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PREX2Q70Z35 1606 aa25.59■■□□□ 1.69
GRAMD4P3-201ENST00000621665 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.58■■□□□ 1.69
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.58■■□□□ 1.69
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.58■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.57■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.55■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.54■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.54■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.52■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.52■■□□□ 1.68
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.5■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TIAM1Q13009 1591 aa25.49■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAP3K1Q13233 1512 aa25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.48■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 APLP2Q06481 763 aa25.47■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ABCC1P33527 1531 aa25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.45■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.43■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KDM5CP41229 1560 aa25.43■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 AFAP1Q8N556 730 aa25.41■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ATP10AO60312 1499 aa25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.39■■□□□ 1.66
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NCOA2Q15596 1464 aa25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.38■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.35■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.33■■□□□ 1.65
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.32■■□□□ 1.64
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
GRAMD4P3-201ENST00000621665 REREQ9P2R6 1566 aa25.29■■□□□ 1.64
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ABCA6Q8N139 1617 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PTPRMP28827 1452 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MADDQ8WXG6 1647 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MIA2Q96PC5 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 AGLP35573 1532 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ATP7AQ04656 1500 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MBD5Q9P267 1494 aa25.2■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MLECQ14165 292 aa25.2■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.19■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.18■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.18■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.16■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TSPY4P0CV99 314 aa25.15■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TSPY10P0CW01 314 aa25.15■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.14■■□□□ 1.62
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.14■■□□□ 1.61
GRAMD4P3-201ENST00000621665 A2MP01023 1474 aa25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.11■■□□□ 1.61
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.06■■□□□ 1.6
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PLXNC1O60486 1568 aa25.05■■□□□ 1.6
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.04■■□□□ 1.6
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FGD6Q6ZV73 1430 aa25■■□□□ 1.59
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25■■□□□ 1.59
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25■■□□□ 1.59
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.97■■□□□ 1.59
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GGT6Q6P531 493 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.94■■□□□ 1.58
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MROH2AA6NES4 1674 aa24.93■■□□□ 1.58
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KIF3BO15066 747 aa24.91■■□□□ 1.58
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 C3P01024 1663 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ABCC5O15440 1437 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DAPK1P53355 1430 aa24.88■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZMYM3Q14202 1370 aa24.87■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.86■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NPATQ14207 1427 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.85■■□□□ 1.57
GRAMD4P3-201ENST00000621665 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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