RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616614.4

FMR1-216, Transcript of fragile X mental retardation 1, humanhuman

TSL 5

Gene FMR1, Length 1,409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1-216ENST00000616614 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa49.96■■■■■ 5.59
FMR1-216ENST00000616614 PREX2Q70Z35 1606 aa49.96■■■■■ 5.59
FMR1-216ENST00000616614 NCOA2Q15596 1464 aa49.96■■■■■ 5.59
FMR1-216ENST00000616614 CCNB3Q8WWL7 1395 aa49.95■■■■■ 5.59
FMR1-216ENST00000616614 CFAP74Q9C0B2 1584 aa49.94■■■■■ 5.59
FMR1-216ENST00000616614 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa49.94■■■■■ 5.58
FMR1-216ENST00000616614 RAPGEF3O95398 923 aa49.93■■■■■ 5.58
FMR1-216ENST00000616614 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP49.88■■■■■ 5.58
FMR1-216ENST00000616614 ADGRL1O94910 1474 aa49.87■■■■■ 5.57
FMR1-216ENST00000616614 SCAPERQ9BY12 1400 aa49.84■■■■■ 5.57
FMR1-216ENST00000616614 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP49.83■■■■■ 5.57
FMR1-216ENST00000616614 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP49.83■■■■■ 5.57
FMR1-216ENST00000616614 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa49.79■■■■■ 5.56
FMR1-216ENST00000616614 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP49.78■■■■■ 5.56
FMR1-216ENST00000616614 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa49.72■■■■■ 5.55
FMR1-216ENST00000616614 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa49.7■■■■■ 5.55
FMR1-216ENST00000616614 POGZQ7Z3K3 1410 aa49.69■■■■■ 5.55
FMR1-216ENST00000616614 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP49.69■■■■■ 5.54
FMR1-216ENST00000616614 RICTORQ6R327 1708 aa49.68■■■■■ 5.54
FMR1-216ENST00000616614 ABCC1P33527 1531 aa49.68■■■■■ 5.54
FMR1-216ENST00000616614 ITSN2Q9NZM3 1697 aa49.65■■■■■ 5.54
FMR1-216ENST00000616614 AFAP1Q8N556 730 aa49.63■■■■■ 5.54
FMR1-216ENST00000616614 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa49.61■■■■■ 5.53
FMR1-216ENST00000616614 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP49.59■■■■■ 5.53
FMR1-216ENST00000616614 MYOM3Q5VTT5 1437 aa49.56■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP49.56■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa49.55■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 SYCP2Q9BX26 1530 aa49.54■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa49.54■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa49.53■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa49.51■■■■■ 5.52
FMR1-216ENST00000616614 KDM5CP41229 1560 aa49.46■■■■■ 5.51
FMR1-216ENST00000616614 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa49.46■■■■■ 5.51
FMR1-216ENST00000616614 MBD5Q9P267 1494 aa49.45■■■■■ 5.51
FMR1-216ENST00000616614 MIA2Q96PC5 1412 aa49.45■■■■■ 5.51
FMR1-216ENST00000616614 YEATS2Q9ULM3 1422 aa49.45■■■■■ 5.51
FMR1-216ENST00000616614 MAGI2Q86UL8 1455 aa49.41■■■■■ 5.5
FMR1-216ENST00000616614 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa49.36■■■■■ 5.49
FMR1-216ENST00000616614 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa49.34■■■■■ 5.49
FMR1-216ENST00000616614 MLH3Q9UHC1 1453 aa49.34■■■■■ 5.49
FMR1-216ENST00000616614 FGD6Q6ZV73 1430 aa49.32■■■■■ 5.49
FMR1-216ENST00000616614 HECW2Q9P2P5 1572 aa49.28■■■■■ 5.48
FMR1-216ENST00000616614 MYT1LQ9UL68 1186 aa49.28■■■■■ 5.48
FMR1-216ENST00000616614 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
FMR1-216ENST00000616614 PTPN23Q9H3S7 1636 aa49.23■■■■■ 5.47
FMR1-216ENST00000616614 CCDC141Q6ZP82 1450 aa49.2■■■■■ 5.47
FMR1-216ENST00000616614 RSPH4AQ5TD94 716 aa49.2■■■■■ 5.47
FMR1-216ENST00000616614 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
FMR1-216ENST00000616614 ATP10AO60312 1499 aa49.19■■■■■ 5.46
FMR1-216ENST00000616614 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa49.19■■■■■ 5.46
FMR1-216ENST00000616614 ARHGEF5Q12774 1597 aa49.18■■■■■ 5.46
FMR1-216ENST00000616614 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa49.15■■■■■ 5.46
FMR1-216ENST00000616614 ABCA6Q8N139 1617 aa49.14■■■■■ 5.46
FMR1-216ENST00000616614 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa49.13■■■■■ 5.46
FMR1-216ENST00000616614 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP49.12■■■■■ 5.45
FMR1-216ENST00000616614 ATP7AQ04656 1500 aa49.12■■■■■ 5.45
FMR1-216ENST00000616614 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa49.1■■■■■ 5.45
FMR1-216ENST00000616614 C9orf84Q5VXU9 1444 aa49.1■■■■■ 5.45
FMR1-216ENST00000616614 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP49.07■■■■■ 5.45
FMR1-216ENST00000616614 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa49.07■■■■■ 5.45
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FMR1-216ENST00000616614 ABCC5O15440 1437 aa49.03■■■■■ 5.44
FMR1-216ENST00000616614 REREQ9P2R6 1566 aa48.96■■■■■ 5.43
FMR1-216ENST00000616614 DAPK1P53355 1430 aa48.96■■■■■ 5.43
FMR1-216ENST00000616614 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.91■■■■■ 5.42
FMR1-216ENST00000616614 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.91■■■■■ 5.42
FMR1-216ENST00000616614 A2MP01023 1474 aa48.89■■■■■ 5.42
FMR1-216ENST00000616614 MLECQ14165 292 aa48.86■■■■■ 5.41
FMR1-216ENST00000616614 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.85■■■■■ 5.41
FMR1-216ENST00000616614 BCORL1Q5H9F3 1711 aa48.85■■■■■ 5.41
FMR1-216ENST00000616614 AGLP35573 1532 aa48.83■■■■■ 5.41
FMR1-216ENST00000616614 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
FMR1-216ENST00000616614 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.82■■■■■ 5.41
FMR1-216ENST00000616614 PLXNC1O60486 1568 aa48.81■■■■■ 5.4
FMR1-216ENST00000616614 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
FMR1-216ENST00000616614 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.8■■■■■ 5.4
FMR1-216ENST00000616614 ADAMTSL3P82987 1691 aa48.78■■■■■ 5.4
FMR1-216ENST00000616614 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.78■■■■■ 5.4
FMR1-216ENST00000616614 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.77■■■■■ 5.4
FMR1-216ENST00000616614 PTPRKQ15262 1439 aa48.76■■■■■ 5.4
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FMR1-216ENST00000616614 MADDQ8WXG6 1647 aa48.66■■■■■ 5.38
FMR1-216ENST00000616614 ITGAEP38570 1179 aa48.65■■■■■ 5.38
FMR1-216ENST00000616614 KIF15Q9NS87 1388 aa48.64■■■■■ 5.38
FMR1-216ENST00000616614 NCOA1Q15788 1441 aa48.64■■■■■ 5.38
FMR1-216ENST00000616614 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa48.62■■■■■ 5.37
FMR1-216ENST00000616614 ADGRL2O95490 1459 aa48.61■■■■■ 5.37
FMR1-216ENST00000616614 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.59■■■■■ 5.37
FMR1-216ENST00000616614 KIF3BO15066 747 aa48.58■■■■■ 5.37
FMR1-216ENST00000616614 GGT6Q6P531 493 aa48.57■■■■■ 5.37
FMR1-216ENST00000616614 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.56■■■■■ 5.36
FMR1-216ENST00000616614 PTPRMP28827 1452 aa48.53■■■■■ 5.36
FMR1-216ENST00000616614 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP48.49■■■■■ 5.35
FMR1-216ENST00000616614 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa48.47■■■■■ 5.35
FMR1-216ENST00000616614 ROCK1Q13464 1354 aa48.45■■■■■ 5.35
FMR1-216ENST00000616614 ERBINQ96RT1 1412 aa48.43■■■■■ 5.34
FMR1-216ENST00000616614 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP48.38■■■■■ 5.34
FMR1-216ENST00000616614 PLPPR3Q6T4P5 718 aa48.36■■■■■ 5.33
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