RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590194.5

SLC25A39-212, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-212ENST00000590194 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.05■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 NEO1Q92859 1461 aa32.04■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.04■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 AKNAQ7Z591 1439 aa32.02■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 KDM6BO15054 1643 aa32.02■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.01■■■□□ 2.72
SLC25A39-212ENST00000590194 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.99■■■□□ 2.71
SLC25A39-212ENST00000590194 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
SLC25A39-212ENST00000590194 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.97■■■□□ 2.71
SLC25A39-212ENST00000590194 ADGRL1O94910 1474 aa31.94■■■□□ 2.7
SLC25A39-212ENST00000590194 RAPGEF3O95398 923 aa31.91■■■□□ 2.7
SLC25A39-212ENST00000590194 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.91■■■□□ 2.7
SLC25A39-212ENST00000590194 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SLC25A39-212ENST00000590194 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.9■■■□□ 2.7
SLC25A39-212ENST00000590194 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.88■■■□□ 2.69
SLC25A39-212ENST00000590194 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC1P33527 1531 aa31.83■■■□□ 2.69
SLC25A39-212ENST00000590194 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.692e-7■■■□□ 14.8
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.82■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 MIA2Q96PC5 1412 aa31.8■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.8■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.79■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 AFAP1Q8N556 730 aa31.79■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.79■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.78■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.78■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 RICTORQ6R327 1708 aa31.77■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.76■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.76■■■□□ 2.68
SLC25A39-212ENST00000590194 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.75■■■□□ 2.67
SLC25A39-212ENST00000590194 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.73■■■□□ 2.67
SLC25A39-212ENST00000590194 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.72■■■□□ 2.67
SLC25A39-212ENST00000590194 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.7■■■□□ 2.66
SLC25A39-212ENST00000590194 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
SLC25A39-212ENST00000590194 MBD5Q9P267 1494 aa31.68■■■□□ 2.66
SLC25A39-212ENST00000590194 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
SLC25A39-212ENST00000590194 KDM5CP41229 1560 aa31.63■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.63■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.57■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.57■■■□□ 2.65
SLC25A39-212ENST00000590194 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.57■■■□□ 2.64
SLC25A39-212ENST00000590194 TSPY4P0CV99 314 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC25A39-212ENST00000590194 TSPY10P0CW01 314 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC25A39-212ENST00000590194 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.55■■■□□ 2.64
SLC25A39-212ENST00000590194 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.52■■■□□ 2.64
SLC25A39-212ENST00000590194 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.51■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC5O15440 1437 aa31.5■■■□□ 2.63
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SLC25A39-212ENST00000590194 DAPK1P53355 1430 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCA6Q8N139 1617 aa31.46■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 ITGAEP38570 1179 aa31.46■■■□□ 2.63
SLC25A39-212ENST00000590194 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.45■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.45■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.44■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 ATP10AO60312 1499 aa31.44■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.44■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.43■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.629e-7■■■□□ 14.9
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SLC25A39-212ENST00000590194 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.39■■■□□ 2.62
SLC25A39-212ENST00000590194 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.38■■■□□ 2.61
SLC25A39-212ENST00000590194 PTPRKQ15262 1439 aa31.35■■■□□ 2.61
SLC25A39-212ENST00000590194 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC25A39-212ENST00000590194 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC25A39-212ENST00000590194 A2MP01023 1474 aa31.32■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.3■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.29■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 REREQ9P2R6 1566 aa31.28■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 MLECQ14165 292 aa31.28■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 PLXNC1O60486 1568 aa31.28■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF15Q9NS87 1388 aa31.27■■■□□ 2.6
SLC25A39-212ENST00000590194 NCOA1Q15788 1441 aa31.25■■■□□ 2.59
SLC25A39-212ENST00000590194 ADGRL2O95490 1459 aa31.24■■■□□ 2.59
SLC25A39-212ENST00000590194 AGLP35573 1532 aa31.2■■■□□ 2.59
SLC25A39-212ENST00000590194 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.19■■■□□ 2.58
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF3BO15066 747 aa31.19■■■□□ 2.58
SLC25A39-212ENST00000590194 ROCK1Q13464 1354 aa31.17■■■□□ 2.58
SLC25A39-212ENST00000590194 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.17■■■□□ 2.58
SLC25A39-212ENST00000590194 GGT6Q6P531 493 aa31.15■■■□□ 2.58
SLC25A39-212ENST00000590194 ERBINQ96RT1 1412 aa31.1■■■□□ 2.57
SLC25A39-212ENST00000590194 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC25A39-212ENST00000590194 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.07■■■□□ 2.56
SLC25A39-212ENST00000590194 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
SLC25A39-212ENST00000590194 MADDQ8WXG6 1647 aa31.05■■■□□ 2.56
SLC25A39-212ENST00000590194 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SLC25A39-212ENST00000590194 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.552e-8■□□□□ 10.4
SLC25A39-212ENST00000590194 NAIPQ13075 1403 aa31.01■■■□□ 2.55
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