RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588315.5

SLC25A39-210, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A39, Length 1,409 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-210ENST00000588315 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
SLC25A39-210ENST00000588315 RICTORQ6R327 1708 aa32.03■■■□□ 2.72
SLC25A39-210ENST00000588315 APLP2Q06481 763 aa32.02■■■□□ 2.72
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGRL1O94910 1474 aa32.02■■■□□ 2.72
SLC25A39-210ENST00000588315 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.01■■■□□ 2.72
SLC25A39-210ENST00000588315 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 PREX2Q70Z35 1606 aa32.01■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.99■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.97■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.97■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 NCOA2Q15596 1464 aa31.96■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.96■■■□□ 2.71
SLC25A39-210ENST00000588315 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
SLC25A39-210ENST00000588315 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.94■■■□□ 2.7
SLC25A39-210ENST00000588315 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
SLC25A39-210ENST00000588315 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.92■■■□□ 2.7
SLC25A39-210ENST00000588315 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.91■■■□□ 2.7
SLC25A39-210ENST00000588315 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.89■■■□□ 2.7
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.87■■■□□ 2.69
SLC25A39-210ENST00000588315 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.86■■■□□ 2.69
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.84■■■□□ 2.69
SLC25A39-210ENST00000588315 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.82■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 AFAP1Q8N556 730 aa31.82■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC1P33527 1531 aa31.81■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.81■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.79■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 KDM5CP41229 1560 aa31.78■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.77■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
SLC25A39-210ENST00000588315 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.76■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.75■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.75■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.74■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 MIA2Q96PC5 1412 aa31.72■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.71■■■□□ 2.67
SLC25A39-210ENST00000588315 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.7■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.68■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.67■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 ATP10AO60312 1499 aa31.66■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.66■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.65■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.65■■■□□ 2.662e-7■■■□□ 14.8
SLC25A39-210ENST00000588315 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.64■■■□□ 2.66
SLC25A39-210ENST00000588315 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.62■■■□□ 2.65
SLC25A39-210ENST00000588315 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.61■■■□□ 2.65
SLC25A39-210ENST00000588315 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.6■■■□□ 2.65
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCA6Q8N139 1617 aa31.59■■■□□ 2.65
SLC25A39-210ENST00000588315 MBD5Q9P267 1494 aa31.59■■■□□ 2.65
SLC25A39-210ENST00000588315 MADDQ8WXG6 1647 aa31.58■■■□□ 2.65
SLC25A39-210ENST00000588315 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.57■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.56■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 PTPRMP28827 1452 aa31.56■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.54■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.53■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 REREQ9P2R6 1566 aa31.51■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 MLECQ14165 292 aa31.51■■■□□ 2.64
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.5■■■□□ 2.63
SLC25A39-210ENST00000588315 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
SLC25A39-210ENST00000588315 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.49■■■□□ 2.63
SLC25A39-210ENST00000588315 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
SLC25A39-210ENST00000588315 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
SLC25A39-210ENST00000588315 ATP7AQ04656 1500 aa31.45■■■□□ 2.62
SLC25A39-210ENST00000588315 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
SLC25A39-210ENST00000588315 AGLP35573 1532 aa31.43■■■□□ 2.62
SLC25A39-210ENST00000588315 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.41■■■□□ 2.62
SLC25A39-210ENST00000588315 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.38■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.37■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.619e-7■■■□□ 14.9
SLC25A39-210ENST00000588315 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.36■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.34■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 PLXNC1O60486 1568 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC5O15440 1437 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 DAPK1P53355 1430 aa31.33■■■□□ 2.61
SLC25A39-210ENST00000588315 A2MP01023 1474 aa31.32■■■□□ 2.6
SLC25A39-210ENST00000588315 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.29■■■□□ 2.6
SLC25A39-210ENST00000588315 TSPY4P0CV99 314 aa31.28■■■□□ 2.6
SLC25A39-210ENST00000588315 TSPY10P0CW01 314 aa31.28■■■□□ 2.6
SLC25A39-210ENST00000588315 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.25■■■□□ 2.59
SLC25A39-210ENST00000588315 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
SLC25A39-210ENST00000588315 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
SLC25A39-210ENST00000588315 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.19■■■□□ 2.58
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGRL2O95490 1459 aa31.18■■■□□ 2.58
SLC25A39-210ENST00000588315 GGT6Q6P531 493 aa31.12■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 C3P01024 1663 aa31.12■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 PTPRKQ15262 1439 aa31.12■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.11■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.1■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 NCOA1Q15788 1441 aa31.1■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.1■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 ROCK1Q13464 1354 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF15Q9NS87 1388 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF3BO15066 747 aa31.06■■■□□ 2.56
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