RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.32■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 CLIP1P30622 1438 aa17.29■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.28■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 ADGRL1O94910 1474 aa17.28■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 NEO1Q92859 1461 aa17.27■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.27■□□□□ 0.36
EFTUD2-209ENST00000587957 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.26■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.25■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF14Q15058 1648 aa17.25■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 FANCAO15360 1455 aa17.24■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 RAPGEF3O95398 923 aa17.24■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.23■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.22■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.21■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.21■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.21■□□□□ 0.35
EFTUD2-209ENST00000587957 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 AKNAQ7Z591 1439 aa17.21■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.19■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.16■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 RICTORQ6R327 1708 aa17.16■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP162Q5TB80 1403 aa17.16■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 PLCH2O75038 1416 aa17.15■□□□□ 0.34
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.13■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.12■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.1■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.1■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.09■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.09■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 PREX2Q70Z35 1606 aa17.09■□□□□ 0.33
EFTUD2-209ENST00000587957 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.08■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.07■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.07■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.06■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.05■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.05■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 APLP2Q06481 763 aa17.03■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.03■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.02■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
EFTUD2-209ENST00000587957 MADDQ8WXG6 1647 aa17.02■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCC1P33527 1531 aa17.01■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.01■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MAGI2Q86UL8 1455 aa17■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.99■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCB7O75027 752 aa16.99■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 MLECQ14165 292 aa16.99■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 AFAP1Q8N556 730 aa16.99■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.99■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.98■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 KDM5CP41229 1560 aa16.97■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRMP28827 1452 aa16.96■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.96■□□□□ 0.31
EFTUD2-209ENST00000587957 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.96■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.96■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.96■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.95■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP10AO60312 1499 aa16.94■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.94■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 ABCA6Q8N139 1617 aa16.93■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 TIAM1Q13009 1591 aa16.93■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.93■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.92■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 NCOA2Q15596 1464 aa16.87■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.87■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.87■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.87■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP7AQ04656 1500 aa16.84■□□□□ 0.29
EFTUD2-209ENST00000587957 REREQ9P2R6 1566 aa16.82■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.82■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.82■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.8■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 AGLP35573 1532 aa16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
EFTUD2-209ENST00000587957 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.76■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 MAP3K1Q13233 1512 aa16.75■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 A2MP01023 1474 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 MBD5Q9P267 1494 aa16.74■□□□□ 0.27
EFTUD2-209ENST00000587957 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms