RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580147.5

PEMT-212, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

TSL 3

Gene PEMT, Length 708 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMT-212ENST00000580147 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.17■■■■□ 3.54
PEMT-212ENST00000580147 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
PEMT-212ENST00000580147 MLECQ14165 292 aa37.12■■■■□ 3.53
PEMT-212ENST00000580147 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.08■■■■□ 3.53
PEMT-212ENST00000580147 CLIP1P30622 1438 aa37.08■■■■□ 3.53
PEMT-212ENST00000580147 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.05■■■■□ 3.52
PEMT-212ENST00000580147 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PEMT-212ENST00000580147 ATP10AO60312 1499 aa37.04■■■■□ 3.52
PEMT-212ENST00000580147 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
PEMT-212ENST00000580147 KIF14Q15058 1648 aa37.03■■■■□ 3.52
PEMT-212ENST00000580147 AFAP1Q8N556 730 aa37.03■■■■□ 3.52
PEMT-212ENST00000580147 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.99■■■■□ 3.51
PEMT-212ENST00000580147 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.99■■■■□ 3.51
PEMT-212ENST00000580147 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.98■■■■□ 3.51
PEMT-212ENST00000580147 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.97■■■■□ 3.51
PEMT-212ENST00000580147 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.96■■■■□ 3.51
PEMT-212ENST00000580147 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.95■■■■□ 3.51
PEMT-212ENST00000580147 HSPA2P54652 639 aa36.94■■■■□ 3.5
PEMT-212ENST00000580147 FBXO41Q8TF61 875 aa36.93■■■■□ 3.5
PEMT-212ENST00000580147 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.93■■■■□ 3.5
PEMT-212ENST00000580147 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.89■■■■□ 3.5
PEMT-212ENST00000580147 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.88■■■■□ 3.49
PEMT-212ENST00000580147 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.85■■■■□ 3.49
PEMT-212ENST00000580147 KDM5CP41229 1560 aa36.83■■■■□ 3.49
PEMT-212ENST00000580147 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
PEMT-212ENST00000580147 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.78■■■■□ 3.48
PEMT-212ENST00000580147 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.78■■■■□ 3.48
PEMT-212ENST00000580147 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.77■■■■□ 3.48
PEMT-212ENST00000580147 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.76■■■■□ 3.48
PEMT-212ENST00000580147 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.76■■■■□ 3.48
PEMT-212ENST00000580147 PREX2Q70Z35 1606 aa36.71■■■■□ 3.47
PEMT-212ENST00000580147 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.71■■■■□ 3.47
PEMT-212ENST00000580147 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
PEMT-212ENST00000580147 ABCC1P33527 1531 aa36.69■■■■□ 3.46
PEMT-212ENST00000580147 REREQ9P2R6 1566 aa36.66■■■■□ 3.46
PEMT-212ENST00000580147 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
PEMT-212ENST00000580147 ABCA6Q8N139 1617 aa36.62■■■■□ 3.45
PEMT-212ENST00000580147 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
PEMT-212ENST00000580147 AGLP35573 1532 aa36.6■■■■□ 3.45
PEMT-212ENST00000580147 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
PEMT-212ENST00000580147 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.57■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.56■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.54■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 CERKQ8TCT0 537 aa36.54■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.52■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.52■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.51■■■■□ 3.44
PEMT-212ENST00000580147 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.5■■■■□ 3.43
PEMT-212ENST00000580147 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.5■■■■□ 3.43
PEMT-212ENST00000580147 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.5■■■■□ 3.43
PEMT-212ENST00000580147 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.49■■■■□ 3.43
PEMT-212ENST00000580147 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.47■■■■□ 3.43
PEMT-212ENST00000580147 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.44■■■■□ 3.42
PEMT-212ENST00000580147 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
PEMT-212ENST00000580147 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.43■■■■□ 3.42
PEMT-212ENST00000580147 C3P01024 1663 aa36.39■■■■□ 3.42
PEMT-212ENST00000580147 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
PEMT-212ENST00000580147 ZMYM3Q14202 1370 aa36.35■■■■□ 3.41
PEMT-212ENST00000580147 ATP7AQ04656 1500 aa36.33■■■■□ 3.41
PEMT-212ENST00000580147 STRCQ7RTU9 1775 aa36.32■■■■□ 3.4
PEMT-212ENST00000580147 CEP162Q5TB80 1403 aa36.31■■■■□ 3.4
PEMT-212ENST00000580147 A2MP01023 1474 aa36.31■■■■□ 3.4
PEMT-212ENST00000580147 GGT6Q6P531 493 aa36.28■■■■□ 3.4
PEMT-212ENST00000580147 PTPRTO14522 1441 aa36.27■■■■□ 3.4
PEMT-212ENST00000580147 NPATQ14207 1427 aa36.26■■■■□ 3.4
PEMT-212ENST00000580147 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.24■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 MBD5Q9P267 1494 aa36.24■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 TIAM1Q13009 1591 aa36.23■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.22■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 PLXNC1O60486 1568 aa36.22■■■■□ 3.39
PEMT-212ENST00000580147 NCOA1Q15788 1441 aa36.18■■■■□ 3.38
PEMT-212ENST00000580147 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.17■■■■□ 3.38
PEMT-212ENST00000580147 MROH2AA6NES4 1674 aa36.16■■■■□ 3.38
PEMT-212ENST00000580147 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 PTPRKQ15262 1439 aa36.11■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.11■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 NCOA2Q15596 1464 aa36.09■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.08■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.08■■■■□ 3.37
PEMT-212ENST00000580147 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.06■■■■□ 3.36
PEMT-212ENST00000580147 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.05■■■■□ 3.36
PEMT-212ENST00000580147 KIF3BO15066 747 aa36.04■■■■□ 3.36
PEMT-212ENST00000580147 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.02■■■■□ 3.36
PEMT-212ENST00000580147 PKD2Q13563 968 aa36.01■■■■□ 3.36
PEMT-212ENST00000580147 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36■■■■□ 3.35
PEMT-212ENST00000580147 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36■■■■□ 3.35
PEMT-212ENST00000580147 TSPY4P0CV99 314 aa35.97■■■■□ 3.35
PEMT-212ENST00000580147 TSPY10P0CW01 314 aa35.97■■■■□ 3.35
PEMT-212ENST00000580147 PLA2R1Q13018 1463 aa35.94■■■■□ 3.34
PEMT-212ENST00000580147 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.94■■■■□ 3.34
PEMT-212ENST00000580147 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
PEMT-212ENST00000580147 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.92■■■■□ 3.34
PEMT-212ENST00000580147 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
PEMT-212ENST00000580147 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.91■■■■□ 3.34
PEMT-212ENST00000580147 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.5 ms