RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.82■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DAPK1P53355 1430 aa34.81■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKNAQ7Z591 1439 aa34.8■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC5O15440 1437 aa34.76■■■■□ 3.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.76■■■■□ 3.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.75■■■■□ 3.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM6BO15054 1643 aa34.72■■■■□ 3.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.68■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.67■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ROCK1Q13464 1354 aa34.67■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM52Q96A61 297 aa34.64■■■■□ 3.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC2Q92887 1545 aa34.6■■■■□ 3.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.57■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.53■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.51■■■■□ 3.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TONSLQ96HA7 1378 aa34.49■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCOA1Q15788 1441 aa34.47■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.46■■■■□ 3.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADGRL2O95490 1459 aa34.44■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PREX2Q70Z35 1606 aa34.43■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.41■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.41■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.4■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.39■■■■□ 3.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.36■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.36■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.36■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXD1Q16676 465 aa34.35■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNH8Q96L42 1107 aa34.35■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.33■■■■□ 3.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.31■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPY4P0CV99 314 aa34.31■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPY10P0CW01 314 aa34.31■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.31■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBD5Q9P267 1494 aa34.3■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.27■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.26■■■■□ 3.08
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.25■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PZPP20742 1482 aa34.23■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.23■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.2■■■■□ 3.07
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF15Q9NS87 1388 aa34.18■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OSCARQ8IYS5 282 aa34.18■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLCH2O75038 1416 aa34.12■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.09■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.07■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.07■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUP155O75694 1391 aa34.07■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKD2Q13563 968 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.04■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.04■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.04■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.03■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.98■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.98■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC1P33527 1531 aa33.96■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLXNC1O60486 1568 aa33.93■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ASXL2Q76L83 1435 aa33.91■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.9■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.89■■■■□ 3.02
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.86■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYT1Q01538 1121 aa33.85■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.85■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.83■■■■□ 3.01
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.82■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FANCAO15360 1455 aa33.81■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UNC13BO14795 1591 aa33.8■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AFAP1Q8N556 730 aa33.78■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.76■■■■□ 3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERBINQ96RT1 1412 aa33.75■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.7■■■□□ 2.99
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADGRL1O94910 1474 aa33.68■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.68■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.68■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCER2I3L3R5 266 aa33.67■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.65■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.64■■■□□ 2.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP7AQ04656 1500 aa33.6■■■□□ 2.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.6■■■□□ 2.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.59■■■□□ 2.97
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