RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570125.5

CARHSP1-215, Transcript of calcium regulated heat stable protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene CARHSP1, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARHSP1-215ENST00000570125 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.23■■■■■ 4.83
CARHSP1-215ENST00000570125 PREX2Q70Z35 1606 aa45.23■■■■■ 4.83
CARHSP1-215ENST00000570125 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.22■■■■■ 4.83
CARHSP1-215ENST00000570125 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.19■■■■■ 4.82
CARHSP1-215ENST00000570125 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.17■■■■■ 4.82
CARHSP1-215ENST00000570125 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.16■■■■■ 4.82
CARHSP1-215ENST00000570125 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa45.15■■■■■ 4.82
CARHSP1-215ENST00000570125 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa45.11■■■■■ 4.81
CARHSP1-215ENST00000570125 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.09■■■■■ 4.81
CARHSP1-215ENST00000570125 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
CARHSP1-215ENST00000570125 TIAM1Q13009 1591 aa45.04■■■■■ 4.8
CARHSP1-215ENST00000570125 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.01■■■■■ 4.8
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCC1P33527 1531 aa45.01■■■■■ 4.8
CARHSP1-215ENST00000570125 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45■■■■■ 4.79
CARHSP1-215ENST00000570125 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.99■■■■■ 4.79
CARHSP1-215ENST00000570125 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.98■■■■■ 4.79
CARHSP1-215ENST00000570125 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.98■■■■■ 4.79
CARHSP1-215ENST00000570125 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.96■■■■■ 4.79
CARHSP1-215ENST00000570125 KDM5CP41229 1560 aa44.94■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.93■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.92■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 AFAP1Q8N556 730 aa44.92■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.88■■■■■ 4.78
CARHSP1-215ENST00000570125 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
CARHSP1-215ENST00000570125 MAP3K1Q13233 1512 aa44.86■■■■■ 4.77
CARHSP1-215ENST00000570125 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.85■■■■■ 4.77
CARHSP1-215ENST00000570125 NCOA2Q15596 1464 aa44.84■■■■■ 4.77
CARHSP1-215ENST00000570125 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
CARHSP1-215ENST00000570125 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.82■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.8■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.8■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.78■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 ATP10AO60312 1499 aa44.77■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.76■■■■■ 4.76
CARHSP1-215ENST00000570125 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.75■■■■■ 4.75
CARHSP1-215ENST00000570125 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.75■■■■■ 4.75
CARHSP1-215ENST00000570125 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
CARHSP1-215ENST00000570125 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.72■■■■■ 4.753e-6■■■■□ 23
CARHSP1-215ENST00000570125 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.72■■■■■ 4.75
CARHSP1-215ENST00000570125 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.7■■■■■ 4.75
CARHSP1-215ENST00000570125 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.69■■■■■ 4.75
CARHSP1-215ENST00000570125 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCA6Q8N139 1617 aa44.68■■■■■ 4.74
CARHSP1-215ENST00000570125 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.65■■■■■ 4.74
CARHSP1-215ENST00000570125 MADDQ8WXG6 1647 aa44.63■■■■■ 4.73
CARHSP1-215ENST00000570125 APLP2Q06481 763 aa44.6■■■■■ 4.73
CARHSP1-215ENST00000570125 REREQ9P2R6 1566 aa44.58■■■■■ 4.73
CARHSP1-215ENST00000570125 MBD5Q9P267 1494 aa44.57■■■■■ 4.73
CARHSP1-215ENST00000570125 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
CARHSP1-215ENST00000570125 PTPRMP28827 1452 aa44.55■■■■■ 4.72
CARHSP1-215ENST00000570125 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.54■■■■■ 4.72
CARHSP1-215ENST00000570125 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
CARHSP1-215ENST00000570125 MLECQ14165 292 aa44.51■■■■■ 4.72
CARHSP1-215ENST00000570125 ATP7AQ04656 1500 aa44.5■■■■■ 4.71
CARHSP1-215ENST00000570125 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
CARHSP1-215ENST00000570125 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.44■■■■■ 4.7
CARHSP1-215ENST00000570125 AGLP35573 1532 aa44.43■■■■■ 4.7
CARHSP1-215ENST00000570125 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.42■■■■■ 4.7
CARHSP1-215ENST00000570125 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.4■■■■■ 4.7
CARHSP1-215ENST00000570125 MIA2Q96PC5 1412 aa44.38■■■■■ 4.69
CARHSP1-215ENST00000570125 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.35■■■■■ 4.69
CARHSP1-215ENST00000570125 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.33■■■■■ 4.69
CARHSP1-215ENST00000570125 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.32■■■■■ 4.69
CARHSP1-215ENST00000570125 PLXNC1O60486 1568 aa44.3■■■■■ 4.68
CARHSP1-215ENST00000570125 A2MP01023 1474 aa44.29■■■■■ 4.68
CARHSP1-215ENST00000570125 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.26■■■■■ 4.68
CARHSP1-215ENST00000570125 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.19■■■■■ 4.66
CARHSP1-215ENST00000570125 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.17■■■■■ 4.66
CARHSP1-215ENST00000570125 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.16■■■■■ 4.66
CARHSP1-215ENST00000570125 TSPY4P0CV99 314 aa44.15■■■■■ 4.66
CARHSP1-215ENST00000570125 TSPY10P0CW01 314 aa44.15■■■■■ 4.66
CARHSP1-215ENST00000570125 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.12■■■■■ 4.65
CARHSP1-215ENST00000570125 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
CARHSP1-215ENST00000570125 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
CARHSP1-215ENST00000570125 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
CARHSP1-215ENST00000570125 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
CARHSP1-215ENST00000570125 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.03■■■■■ 4.64
CARHSP1-215ENST00000570125 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.02■■■■■ 4.64
CARHSP1-215ENST00000570125 C3P01024 1663 aa44.01■■■■■ 4.64
CARHSP1-215ENST00000570125 ABCC5O15440 1437 aa43.99■■■■■ 4.63
CARHSP1-215ENST00000570125 GGT6Q6P531 493 aa43.99■■■■■ 4.63
CARHSP1-215ENST00000570125 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.99■■■■■ 4.63
CARHSP1-215ENST00000570125 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
CARHSP1-215ENST00000570125 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.96■■■■■ 4.63
CARHSP1-215ENST00000570125 MROH2AA6NES4 1674 aa43.94■■■■■ 4.63
CARHSP1-215ENST00000570125 DAPK1P53355 1430 aa43.94■■■■■ 4.62
CARHSP1-215ENST00000570125 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
CARHSP1-215ENST00000570125 KIF3BO15066 747 aa43.91■■■■■ 4.62
CARHSP1-215ENST00000570125 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.88■■■■■ 4.62
CARHSP1-215ENST00000570125 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.87■■■■■ 4.61
CARHSP1-215ENST00000570125 ZMYM3Q14202 1370 aa43.86■■■■■ 4.61
CARHSP1-215ENST00000570125 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
CARHSP1-215ENST00000570125 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
CARHSP1-215ENST00000570125 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
CARHSP1-215ENST00000570125 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.8■■■■■ 4.6
CARHSP1-215ENST00000570125 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
CARHSP1-215ENST00000570125 KIF15Q9NS87 1388 aa43.78■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms