RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.74■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 PTPRKQ15262 1439 aa30.73■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.72■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.71■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 DAPK1P53355 1430 aa30.7■■■□□ 2.51
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.69■■■□□ 2.5
CTU2-208ENST00000566637 ABCC5O15440 1437 aa30.66■■■□□ 2.5
CTU2-208ENST00000566637 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.65■■■□□ 2.5
CTU2-208ENST00000566637 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CTU2-208ENST00000566637 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.64■■■□□ 2.5
CTU2-208ENST00000566637 HFM1A2PYH4 1435 aa30.64■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 PLCH2O75038 1416 aa30.64■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.63■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.62■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 AKNAQ7Z591 1439 aa30.62■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.6■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.58■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.58■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.58■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 MAPKBP1O60336 1514 aa30.58■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.58■■■□□ 2.49
CTU2-208ENST00000566637 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.57■■■□□ 2.48
CTU2-208ENST00000566637 ROCK1Q13464 1354 aa30.56■■■□□ 2.48
CTU2-208ENST00000566637 NAIPQ13075 1403 aa30.55■■■□□ 2.48
CTU2-208ENST00000566637 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.55■■■□□ 2.48
CTU2-208ENST00000566637 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.53■■■□□ 2.48
CTU2-208ENST00000566637 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.51■■■□□ 2.48
CTU2-208ENST00000566637 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.51■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.5■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 MBD5Q9P267 1494 aa30.5■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.5■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.49■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 ADGRL2O95490 1459 aa30.48■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 ABCC1P33527 1531 aa30.46■■■□□ 2.47
CTU2-208ENST00000566637 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.45■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 TSPY4P0CV99 314 aa30.44■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 TSPY10P0CW01 314 aa30.44■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.43■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 FANCAO15360 1455 aa30.43■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 NCOA1Q15788 1441 aa30.4■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 CD109Q6YHK3 1445 aa30.4■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.39■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.39■■■□□ 2.46
CTU2-208ENST00000566637 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.39■■■□□ 2.45
CTU2-208ENST00000566637 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.37■■■□□ 2.45
CTU2-208ENST00000566637 GLI2P10070 1586 aa30.36■■■□□ 2.45
CTU2-208ENST00000566637 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
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CTU2-208ENST00000566637 ADGRL1O94910 1474 aa30.31■■■□□ 2.44
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CTU2-208ENST00000566637 DIP2BQ9P265 1576 aa30.28■■■□□ 2.44
CTU2-208ENST00000566637 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.28■■■□□ 2.44
CTU2-208ENST00000566637 PLXNC1O60486 1568 aa30.27■■■□□ 2.44
CTU2-208ENST00000566637 KIF15Q9NS87 1388 aa30.26■■■□□ 2.43
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CTU2-208ENST00000566637 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.24■■■□□ 2.43
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CTU2-208ENST00000566637 NEO1Q92859 1461 aa30.22■■■□□ 2.43
CTU2-208ENST00000566637 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-208ENST00000566637 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CTU2-208ENST00000566637 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.18■■■□□ 2.42
CTU2-208ENST00000566637 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.16■■■□□ 2.42
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CTU2-208ENST00000566637 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.14■■■□□ 2.42
CTU2-208ENST00000566637 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.14■■■□□ 2.42
CTU2-208ENST00000566637 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CTU2-208ENST00000566637 ATP7AQ04656 1500 aa30.12■■■□□ 2.41
CTU2-208ENST00000566637 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.1■■■□□ 2.41
CTU2-208ENST00000566637 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 ERBINQ96RT1 1412 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.07■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 KDM5CP41229 1560 aa30.06■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 TSPOAP1O95153 1857 aa30.05■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.05■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 PZPP20742 1482 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-208ENST00000566637 UNC13BO14795 1591 aa30■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 HECW2Q9P2P5 1572 aa30■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.99■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 NUP155O75694 1391 aa29.98■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.97■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 RICTORQ6R327 1708 aa29.97■■■□□ 2.39
CTU2-208ENST00000566637 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.93■■■□□ 2.38
CTU2-208ENST00000566637 NEUROD1Q13562 356 aa29.92■■■□□ 2.38
CTU2-208ENST00000566637 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTU2-208ENST00000566637 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CTU2-208ENST00000566637 RAPGEF3O95398 923 aa29.89■■■□□ 2.38
CTU2-208ENST00000566637 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.89■■■□□ 2.38
CTU2-208ENST00000566637 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.89■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.87■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.87■■■□□ 2.37
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