RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.83■■■□□ 2.05
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MFGE8-210ENST00000559259 NEO1Q92859 1461 aa27.83■■■□□ 2.04
MFGE8-210ENST00000559259 MIA2Q96PC5 1412 aa27.8■■■□□ 2.04
MFGE8-210ENST00000559259 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.8■■■□□ 2.04
MFGE8-210ENST00000559259 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.77■■■□□ 2.04
MFGE8-210ENST00000559259 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
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MFGE8-210ENST00000559259 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-210ENST00000559259 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-210ENST00000559259 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.75■■■□□ 2.03
MFGE8-210ENST00000559259 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
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MFGE8-210ENST00000559259 AKNAQ7Z591 1439 aa27.66■■■□□ 2.02
MFGE8-210ENST00000559259 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.65■■■□□ 2.02
MFGE8-210ENST00000559259 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.65■■■□□ 2.02
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MFGE8-210ENST00000559259 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.62■■■□□ 2.01
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MFGE8-210ENST00000559259 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.58■■■□□ 2.01
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MFGE8-210ENST00000559259 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.46■■□□□ 1.99
MFGE8-210ENST00000559259 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.44■■□□□ 1.98
MFGE8-210ENST00000559259 MADDQ8WXG6 1647 aa27.44■■□□□ 1.98
MFGE8-210ENST00000559259 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.43■■□□□ 1.98
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MFGE8-210ENST00000559259 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
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MFGE8-210ENST00000559259 MBD5Q9P267 1494 aa27.4■■□□□ 1.98
MFGE8-210ENST00000559259 DAPK1P53355 1430 aa27.39■■□□□ 1.97
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MFGE8-210ENST00000559259 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.38■■□□□ 1.97
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MFGE8-210ENST00000559259 PTPRMP28827 1452 aa27.32■■□□□ 1.96
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MFGE8-210ENST00000559259 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
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MFGE8-210ENST00000559259 MLECQ14165 292 aa27.1■■□□□ 1.93
MFGE8-210ENST00000559259 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.1■■□□□ 1.93
MFGE8-210ENST00000559259 AGLP35573 1532 aa27.08■■□□□ 1.93
MFGE8-210ENST00000559259 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.07■■□□□ 1.92
MFGE8-210ENST00000559259 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.06■■□□□ 1.92
MFGE8-210ENST00000559259 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.06■■□□□ 1.92
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