RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.09■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.09■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.08■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.08■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.08■■■■□ 3.21
CIPC-208ENST00000557115 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.07■■■■□ 3.2
CIPC-208ENST00000557115 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.06■■■■□ 3.2
CIPC-208ENST00000557115 PTPRMP28827 1452 aa35.05■■■■□ 3.2
CIPC-208ENST00000557115 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.04■■■■□ 3.2
CIPC-208ENST00000557115 MYT1LQ9UL68 1186 aa35■■■■□ 3.19
CIPC-208ENST00000557115 AFAP1Q8N556 730 aa34.96■■■■□ 3.19
CIPC-208ENST00000557115 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.96■■■■□ 3.19
CIPC-208ENST00000557115 MADDQ8WXG6 1647 aa34.95■■■■□ 3.19
CIPC-208ENST00000557115 MLECQ14165 292 aa34.95■■■■□ 3.19
CIPC-208ENST00000557115 ATP10AO60312 1499 aa34.91■■■■□ 3.18
CIPC-208ENST00000557115 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.89■■■■□ 3.18
CIPC-208ENST00000557115 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.88■■■■□ 3.17
CIPC-208ENST00000557115 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.87■■■■□ 3.17
CIPC-208ENST00000557115 PREX2Q70Z35 1606 aa34.86■■■■□ 3.17
CIPC-208ENST00000557115 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CIPC-208ENST00000557115 CEP162Q5TB80 1403 aa34.84■■■■□ 3.17
CIPC-208ENST00000557115 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CIPC-208ENST00000557115 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.82■■■■□ 3.16
CIPC-208ENST00000557115 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.82■■■■□ 3.16
CIPC-208ENST00000557115 KDM5CP41229 1560 aa34.81■■■■□ 3.16
CIPC-208ENST00000557115 ABCC1P33527 1531 aa34.79■■■■□ 3.16
CIPC-208ENST00000557115 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.79■■■■□ 3.16
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.76■■■■□ 3.16
CIPC-208ENST00000557115 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.75■■■■□ 3.15
CIPC-208ENST00000557115 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.74■■■■□ 3.15
CIPC-208ENST00000557115 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.74■■■■□ 3.15
CIPC-208ENST00000557115 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
CIPC-208ENST00000557115 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
CIPC-208ENST00000557115 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.7■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.69■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.68■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.67■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.65■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.64■■■■□ 3.14
CIPC-208ENST00000557115 ABCA6Q8N139 1617 aa34.63■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.62■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.6■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.6■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 REREQ9P2R6 1566 aa34.59■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.57■■■■□ 3.13
CIPC-208ENST00000557115 HSPA2P54652 639 aa34.57■■■■□ 3.12
CIPC-208ENST00000557115 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.54■■■■□ 3.12
CIPC-208ENST00000557115 AGLP35573 1532 aa34.53■■■■□ 3.12
CIPC-208ENST00000557115 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CIPC-208ENST00000557115 TIAM1Q13009 1591 aa34.49■■■■□ 3.11
CIPC-208ENST00000557115 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.46■■■■□ 3.11
CIPC-208ENST00000557115 ATP7AQ04656 1500 aa34.45■■■■□ 3.1
CIPC-208ENST00000557115 NCOA2Q15596 1464 aa34.41■■■■□ 3.1
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CIPC-208ENST00000557115 A2MP01023 1474 aa34.37■■■■□ 3.09
CIPC-208ENST00000557115 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.37■■■■□ 3.09
CIPC-208ENST00000557115 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CIPC-208ENST00000557115 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.36■■■■□ 3.09
CIPC-208ENST00000557115 MBD5Q9P267 1494 aa34.35■■■■□ 3.09
CIPC-208ENST00000557115 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.35■■■■□ 3.09
CIPC-208ENST00000557115 GGT6Q6P531 493 aa34.31■■■■□ 3.08
CIPC-208ENST00000557115 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.3■■■■□ 3.08
CIPC-208ENST00000557115 C3P01024 1663 aa34.29■■■■□ 3.08
CIPC-208ENST00000557115 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.28■■■■□ 3.08
CIPC-208ENST00000557115 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.27■■■■□ 3.08
CIPC-208ENST00000557115 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.27■■■■□ 3.08
CIPC-208ENST00000557115 PLXNC1O60486 1568 aa34.26■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.25■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 ZMYM3Q14202 1370 aa34.24■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 FBXO41Q8TF61 875 aa34.23■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 APLP2Q06481 763 aa34.21■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.21■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 TSPY4P0CV99 314 aa34.2■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 TSPY10P0CW01 314 aa34.2■■■■□ 3.07
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K1Q13233 1512 aa34.2■■■■□ 3.06
CIPC-208ENST00000557115 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.19■■■■□ 3.06
CIPC-208ENST00000557115 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.18■■■■□ 3.06
CIPC-208ENST00000557115 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CIPC-208ENST00000557115 NPATQ14207 1427 aa34.15■■■■□ 3.06
CIPC-208ENST00000557115 MROH2AA6NES4 1674 aa34.15■■■■□ 3.06
CIPC-208ENST00000557115 KIF3BO15066 747 aa34.13■■■■□ 3.05
CIPC-208ENST00000557115 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.08■■■■□ 3.05
CIPC-208ENST00000557115 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.07■■■■□ 3.04
CIPC-208ENST00000557115 CERKQ8TCT0 537 aa34.05■■■■□ 3.04
CIPC-208ENST00000557115 MIA2Q96PC5 1412 aa34.04■■■■□ 3.04
CIPC-208ENST00000557115 PTPRKQ15262 1439 aa34.03■■■■□ 3.04
CIPC-208ENST00000557115 STRCQ7RTU9 1775 aa34.03■■■■□ 3.04
CIPC-208ENST00000557115 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34■■■■□ 3.03
CIPC-208ENST00000557115 NCOA1Q15788 1441 aa33.96■■■■□ 3.03
CIPC-208ENST00000557115 PTPRTO14522 1441 aa33.96■■■■□ 3.03
CIPC-208ENST00000557115 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.93■■■■□ 3.02
CIPC-208ENST00000557115 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.92■■■■□ 3.02
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