RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553238.5

SLC8B1-216, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 5

Gene SLC8B1, Length 1,675 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-216ENST00000553238 PTPRKQ15262 1439 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC8B1-216ENST00000553238 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC8B1-216ENST00000553238 ITGAEP38570 1179 aa20.65■□□□□ 0.9
SLC8B1-216ENST00000553238 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.64■□□□□ 0.9
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 KCNH8Q96L42 1107 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 TSPOAP1O95153 1857 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 PLCH2O75038 1416 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCC5O15440 1437 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 DAPK1P53355 1430 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC8B1-216ENST00000553238 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 HFM1A2PYH4 1435 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 AKNAQ7Z591 1439 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 MBD5Q9P267 1494 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC8B1-216ENST00000553238 HRCP23327 699 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 NAIPQ13075 1403 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 ROCK1Q13464 1354 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 GLI2P10070 1586 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 ADGRL2O95490 1459 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-216ENST00000553238 ABCC1P33527 1531 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 NCOA1Q15788 1441 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 KDM6BO15054 1643 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 FANCAO15360 1455 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.41■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 CD109Q6YHK3 1445 aa20.41■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.41■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.4■□□□□ 0.86
SLC8B1-216ENST00000553238 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 TSPY4P0CV99 314 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 TSPY10P0CW01 314 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.35■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 ADGRL1O94910 1474 aa20.33■□□□□ 0.85
SLC8B1-216ENST00000553238 PLXNC1O60486 1568 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 NEO1Q92859 1461 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC8B1-216ENST00000553238 KIF15Q9NS87 1388 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 AFAP1Q8N556 730 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.25■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 KDM5CP41229 1560 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 ATP7AQ04656 1500 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC8B1-216ENST00000553238 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 RICTORQ6R327 1708 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 ERBINQ96RT1 1412 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 PZPP20742 1482 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 TRIM52Q96A61 297 aa20.15■□□□□ 0.82
SLC8B1-216ENST00000553238 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 UNC13BO14795 1591 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 RAPGEF3O95398 923 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SLC8B1-216ENST00000553238 NUP155O75694 1391 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC8B1-216ENST00000553238 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC8B1-216ENST00000553238 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC8B1-216ENST00000553238 DEPDC5O75140 1603 aa20.06■□□□□ 0.8
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