RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-230ENST00000551968 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CS-230ENST00000551968 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.58■■□□□ 1.36
CS-230ENST00000551968 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-230ENST00000551968 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.53■■□□□ 1.36
CS-230ENST00000551968 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CS-230ENST00000551968 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.49■■□□□ 1.35
CS-230ENST00000551968 ATP10AO60312 1499 aa23.47■■□□□ 1.35
CS-230ENST00000551968 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.45■■□□□ 1.34
CS-230ENST00000551968 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.44■■□□□ 1.34
CS-230ENST00000551968 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.43■■□□□ 1.34
CS-230ENST00000551968 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CS-230ENST00000551968 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.42■■□□□ 1.34
CS-230ENST00000551968 PLCH2O75038 1416 aa23.41■■□□□ 1.34
CS-230ENST00000551968 PTPRTO14522 1441 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-230ENST00000551968 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-230ENST00000551968 C3P01024 1663 aa23.37■■□□□ 1.33
CS-230ENST00000551968 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CS-230ENST00000551968 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.33■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 AFAP1Q8N556 730 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 KDM5CP41229 1560 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 KIF14Q15058 1648 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 ABCA6Q8N139 1617 aa23.27■■□□□ 1.32
CS-230ENST00000551968 NCOA1Q15788 1441 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-230ENST00000551968 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-230ENST00000551968 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.26■■□□□ 1.31
CS-230ENST00000551968 REREQ9P2R6 1566 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-230ENST00000551968 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.21■■□□□ 1.31
CS-230ENST00000551968 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.19■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 AGLP35573 1532 aa23.16■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.15■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.14■■□□□ 1.3
CS-230ENST00000551968 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CS-230ENST00000551968 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.12■■□□□ 1.29
CS-230ENST00000551968 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.1■■□□□ 1.29
CS-230ENST00000551968 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CS-230ENST00000551968 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CS-230ENST00000551968 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.09■■□□□ 1.29
CS-230ENST00000551968 ABCC1P33527 1531 aa23.08■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 MROH2AA6NES4 1674 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 EEA1Q15075 1411 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 NPATQ14207 1427 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 PREX2Q70Z35 1606 aa23.04■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.02■■□□□ 1.28
CS-230ENST00000551968 ZMYM3Q14202 1370 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 FMN1Q68DA7 1419 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 HSPA1LP34931 641 aa23■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 CLIP1P30622 1438 aa22.99■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 PLA2R1Q13018 1463 aa22.97■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-230ENST00000551968 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.95■■□□□ 1.26
CS-230ENST00000551968 PKD2Q13563 968 aa22.93■■□□□ 1.26
CS-230ENST00000551968 PTPRKQ15262 1439 aa22.92■■□□□ 1.26
CS-230ENST00000551968 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CS-230ENST00000551968 PIP4K2BP78356 416 aa22.92■■□□□ 1.26
CS-230ENST00000551968 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.9■■□□□ 1.26
CS-230ENST00000551968 PLXNC1O60486 1568 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 ALKQ9UM73 1620 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-230ENST00000551968 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 ATP7AQ04656 1500 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 A2MP01023 1474 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 GGT6Q6P531 493 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 CPS1P31327 1500 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 TOM1O60784 492 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CS-230ENST00000551968 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-230ENST00000551968 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-230ENST00000551968 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-230ENST00000551968 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-230ENST00000551968 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CS-230ENST00000551968 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-230ENST00000551968 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.68■■□□□ 1.22
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